More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1102 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
293 aa  586  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.62 
 
 
294 aa  247  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.24 
 
 
289 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.912812 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13610  carbohydrate ABC transporter membrane protein  44.16 
 
 
329 aa  247  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.79 
 
 
311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.99 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168129  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.24 
 
 
292 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000117143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
290 aa  236  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.36 
 
 
296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05730  carbohydrate ABC transporter membrane protein  43 
 
 
313 aa  232  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.709273  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1291  hypothetical protein  44.96 
 
 
299 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.65 
 
 
300 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.18 
 
 
297 aa  228  8e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 
335 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0172593  normal  0.0301205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10100  carbohydrate ABC transporter membrane protein  45.11 
 
 
285 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.849454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.26 
 
 
315 aa  226  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.37 
 
 
304 aa  225  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.451353 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.92 
 
 
281 aa  225  8e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00144741  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04180  carbohydrate ABC transporter membrane protein  44.01 
 
 
327 aa  223  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29180  carbohydrate ABC transporter membrane protein  42.07 
 
 
320 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
294 aa  222  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.369342  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
302 aa  219  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
290 aa  219  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.11 
 
 
307 aa  217  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.55 
 
 
317 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
301 aa  212  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
298 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000904661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.84 
 
 
299 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
296 aa  209  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
296 aa  209  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1611  putative transport system integral membrane protein  44.09 
 
 
303 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.875629  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.12 
 
 
321 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.499176  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  38.52 
 
 
302 aa  202  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
305 aa  202  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0958924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00968788  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117881  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1581  ABC-type sugar transport system, permease component  39.54 
 
 
287 aa  199  5e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
299 aa  198  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
304 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.32 
 
 
306 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475945  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
318 aa  195  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451347  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.87 
 
 
293 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
296 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
303 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
303 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
296 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
300 aa  192  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
289 aa  192  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.258106  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
292 aa  192  8e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
302 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
284 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340463  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
301 aa  188  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
294 aa  188  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.576664  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.92 
 
 
315 aa  188  9e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1562  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  37.23 
 
 
290 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0590274  normal  0.820789 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2338  ABC transporter, permease protein  38.95 
 
 
318 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2050  sugar transport system (permease) (binding protein dependent transporter)  38.95 
 
 
318 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
310 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
313 aa  186  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0225892  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
311 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20500  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.33 
 
 
306 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00619116  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
320 aa  185  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  38.4 
 
 
312 aa  185  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410884  normal  0.713959 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01650  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.42 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
309 aa  183  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
300 aa  183  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 
307 aa  182  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.392519  normal  0.062239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
311 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
297 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
326 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00903447  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
283 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.528009  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
307 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0762  ABC-type sugar transport system, permease component  33.77 
 
 
300 aa  169  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0168345  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
307 aa  166  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
408 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
330 aa  159  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0364153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.05 
 
 
300 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  34.92 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
270 aa  142  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
288 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
290 aa  139  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
270 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.05 
 
 
302 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.85 
 
 
305 aa  133  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0148237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
283 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
289 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>