More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0129 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
299 aa  589  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.95 
 
 
300 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.89 
 
 
284 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340463  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.3 
 
 
293 aa  255  8e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.67 
 
 
317 aa  251  9.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04180  carbohydrate ABC transporter membrane protein  45.36 
 
 
327 aa  245  4.9999999999999997e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.78 
 
 
311 aa  242  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13610  carbohydrate ABC transporter membrane protein  45.58 
 
 
329 aa  242  7e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230685  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05730  carbohydrate ABC transporter membrane protein  45.7 
 
 
313 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.709273  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.59 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.451353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1291  hypothetical protein  43.2 
 
 
299 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.14 
 
 
315 aa  226  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
335 aa  223  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0172593  normal  0.0301205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
322 aa  222  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
317 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00968788  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29180  carbohydrate ABC transporter membrane protein  42.57 
 
 
320 aa  216  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1611  putative transport system integral membrane protein  45.42 
 
 
303 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.875629  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10100  carbohydrate ABC transporter membrane protein  44.03 
 
 
285 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.849454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.7 
 
 
321 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.499176  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.84 
 
 
293 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
290 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
298 aa  185  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000904661  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
320 aa  183  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
326 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00903447  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.78 
 
 
281 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00144741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
283 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.528009  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
297 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
304 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
300 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
303 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
320 aa  175  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168129  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
294 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451347  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.5 
 
 
312 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410884  normal  0.713959 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
300 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
313 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0225892  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
296 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
301 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
306 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475945  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
289 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.912812 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
290 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.33 
 
 
302 aa  166  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
307 aa  166  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.77 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1562  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.75 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0590274  normal  0.820789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20500  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.14 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00619116  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0958924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
306 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.258106  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01650  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.9 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
294 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.369342  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2050  sugar transport system (permease) (binding protein dependent transporter)  34.97 
 
 
318 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
309 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
307 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.392519  normal  0.062239 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2338  ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 
318 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
294 aa  158  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
299 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1581  ABC-type sugar transport system, permease component  35.11 
 
 
287 aa  156  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
300 aa  156  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
307 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
292 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000117143  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0762  ABC-type sugar transport system, permease component  36.33 
 
 
300 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0168345  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
302 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
296 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
311 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
296 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
313 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
314 aa  149  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.41 
 
 
301 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
408 aa  145  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
311 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
297 aa  139  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.95 
 
 
294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.576664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
303 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.09 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
286 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.94 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0364153  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  29.17 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
302 aa  112  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  30 
 
 
278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  28.57 
 
 
278 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.08 
 
 
275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
298 aa  109  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0175  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.96 
 
 
278 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.54 
 
 
290 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
278 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2532  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.34 
 
 
275 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.47 
 
 
311 aa  106  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
312 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>