More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1980 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
313 aa  617  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  75.78 
 
 
312 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410884  normal  0.713959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1562  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  73.01 
 
 
290 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0590274  normal  0.820789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.62 
 
 
306 aa  414  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475945  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.77 
 
 
307 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.392519  normal  0.062239 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.63 
 
 
313 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0225892  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.84 
 
 
309 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01650  carbohydrate ABC transporter membrane protein  62.3 
 
 
308 aa  382  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20500  carbohydrate ABC transporter membrane protein  66.89 
 
 
306 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00619116  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.62 
 
 
309 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62 
 
 
311 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1581  ABC-type sugar transport system, permease component  60.9 
 
 
287 aa  363  1e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.45 
 
 
307 aa  342  4e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.97 
 
 
306 aa  289  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 
289 aa  247  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.258106  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.12 
 
 
297 aa  232  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
290 aa  231  9e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
294 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29180  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.86 
 
 
320 aa  226  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
296 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
290 aa  219  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
290 aa  218  8.999999999999998e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
294 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.369342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
294 aa  209  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117881  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.57 
 
 
289 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.912812 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
301 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
302 aa  203  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.55 
 
 
315 aa  202  6e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000117143  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.8 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
296 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
295 aa  195  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 
287 aa  195  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168129  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
297 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
296 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
296 aa  192  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
335 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0172593  normal  0.0301205 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
303 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05730  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.89 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.709273  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
299 aa  189  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
298 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000904661  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
292 aa  189  7e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
281 aa  188  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00144741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
305 aa  188  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0958924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
304 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0762  ABC-type sugar transport system, permease component  35.25 
 
 
300 aa  187  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0168345  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04180  carbohydrate ABC transporter membrane protein  38.79 
 
 
327 aa  186  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.37 
 
 
300 aa  185  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451347  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
302 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13610  carbohydrate ABC transporter membrane protein  38.01 
 
 
329 aa  179  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
296 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.51 
 
 
284 aa  178  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340463  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
294 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.576664  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
293 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1291  hypothetical protein  37.06 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
303 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1611  putative transport system integral membrane protein  38.89 
 
 
303 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.875629  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
307 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2338  ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 
318 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
326 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00903447  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2050  sugar transport system (permease) (binding protein dependent transporter)  32.1 
 
 
318 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
317 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00968788  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
283 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.528009  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10100  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.07 
 
 
285 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.849454 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
330 aa  165  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0364153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.499176  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
317 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
293 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
300 aa  159  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
304 aa  159  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.451353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
299 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
286 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 
408 aa  156  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
307 aa  152  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.85 
 
 
310 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  27.02 
 
 
276 aa  129  6e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 
273 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
275 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.99 
 
 
300 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
315 aa  122  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  28.87 
 
 
269 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  27.93 
 
 
275 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.71 
 
 
302 aa  119  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.23 
 
 
302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341564  decreased coverage  0.00499995 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.02 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>