More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33160 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_33160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  100 
 
 
312 aa  626  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410884  normal  0.713959 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.61 
 
 
313 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0225892  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1562  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  72.66 
 
 
290 aa  434  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0590274  normal  0.820789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.12 
 
 
313 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.35 
 
 
306 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475945  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.16 
 
 
307 aa  431  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.392519  normal  0.062239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.97 
 
 
309 aa  415  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20500  carbohydrate ABC transporter membrane protein  64.8 
 
 
306 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00619116  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.32 
 
 
309 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01650  carbohydrate ABC transporter membrane protein  62.21 
 
 
308 aa  396  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.72 
 
 
311 aa  387  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.03 
 
 
307 aa  371  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1581  ABC-type sugar transport system, permease component  59.86 
 
 
287 aa  350  3e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.42 
 
 
306 aa  300  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.84 
 
 
289 aa  244  9e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.258106  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 
290 aa  236  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.75 
 
 
290 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
294 aa  226  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29180  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.21 
 
 
320 aa  225  7e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
290 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.22 
 
 
302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
294 aa  216  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117881  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
320 aa  216  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.23 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
294 aa  209  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.369342  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
296 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.61 
 
 
287 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168129  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
302 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.56 
 
 
292 aa  206  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000117143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
281 aa  205  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00144741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
301 aa  203  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
298 aa  199  7e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000904661  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451347  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04180  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.88 
 
 
327 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
294 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.576664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
303 aa  193  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
305 aa  192  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0958924  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
311 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
289 aa  192  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.912812 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
296 aa  192  9e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0762  ABC-type sugar transport system, permease component  36.27 
 
 
300 aa  191  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0168345  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.29 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05730  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35 
 
 
313 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.709273  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
304 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340463  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0172593  normal  0.0301205 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
320 aa  183  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.6 
 
 
315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13610  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.94 
 
 
329 aa  182  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
299 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
300 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
302 aa  179  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
296 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
283 aa  177  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.528009  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.34 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00903447  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
307 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
300 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
322 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1291  hypothetical protein  35.05 
 
 
299 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.35 
 
 
314 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
303 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
317 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00968788  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10100  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
285 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.849454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1611  putative transport system integral membrane protein  35.31 
 
 
303 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.875629  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
315 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
300 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 
408 aa  162  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.13 
 
 
330 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0364153  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2338  ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 
318 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2050  sugar transport system (permease) (binding protein dependent transporter)  31.48 
 
 
318 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
304 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.451353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
301 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
307 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
321 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.499176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
317 aa  152  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  32.39 
 
 
276 aa  151  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
293 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
311 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
286 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
310 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.85 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.85 
 
 
304 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.93 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2716  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  27.97 
 
 
293 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 
275 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.91 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341564  decreased coverage  0.00499995 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  29.85 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  26.86 
 
 
275 aa  116  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.11 
 
 
273 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.09 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>