More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2570 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2570  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
311 aa  627  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2050  sugar transport system (permease) (binding protein dependent transporter)  45.45 
 
 
318 aa  281  8.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2338  ABC transporter, permease protein  44.78 
 
 
318 aa  279  4e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.83 
 
 
301 aa  275  7e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.05 
 
 
307 aa  275  8e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.58 
 
 
310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
300 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.11 
 
 
303 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
294 aa  192  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.369342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
296 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
305 aa  183  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0958924  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
293 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29180  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.4 
 
 
320 aa  178  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
290 aa  172  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
290 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
292 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000117143  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
296 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
299 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1562  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.86 
 
 
290 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0590274  normal  0.820789 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
296 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05730  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.56 
 
 
313 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.709273  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1581  ABC-type sugar transport system, permease component  36.13 
 
 
287 aa  166  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 
294 aa  165  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01650  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.22 
 
 
308 aa  165  9e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13610  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.67 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1873  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168129  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04180  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.32 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0225892  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00144741  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
306 aa  162  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0762  ABC-type sugar transport system, permease component  33.82 
 
 
300 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0168345  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
303 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
289 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.258106  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
302 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
309 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
311 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
300 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
297 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
307 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20500  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.43 
 
 
306 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00619116  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
295 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
306 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475945  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.39 
 
 
298 aa  155  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000904661  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.73 
 
 
312 aa  155  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410884  normal  0.713959 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
294 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.576664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1291  hypothetical protein  35.57 
 
 
299 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10100  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.9 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.849454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
322 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
320 aa  153  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
302 aa  153  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
304 aa  152  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.451353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.32 
 
 
294 aa  152  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117881  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 
317 aa  152  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.88 
 
 
315 aa  151  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
307 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.392519  normal  0.062239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
299 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
301 aa  149  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
318 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451347  normal  0.228121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
313 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
289 aa  149  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.912812 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
304 aa  149  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.25 
 
 
302 aa  148  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00968788  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
314 aa  146  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
315 aa  146  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
292 aa  144  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
335 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0172593  normal  0.0301205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
284 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340463  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
408 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
293 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.528009  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
309 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
326 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00903447  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
297 aa  136  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.32 
 
 
286 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1611  putative transport system integral membrane protein  32.45 
 
 
303 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.875629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.08 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0364153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.499176  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06939  hypothetical protein  28.62 
 
 
294 aa  126  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  33.06 
 
 
276 aa  124  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.33 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0410  Monosaccharide-transporting ATPase  28.06 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.11 
 
 
304 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
300 aa  113  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  0.306181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.61 
 
 
301 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  27.24 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.96 
 
 
294 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
302 aa  112  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1066  sugar ABC transporter permease  28.83 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.317324 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0530  sugar ABC transporter, permease protein  28.83 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>