244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5030 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  744    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  69.65 
 
 		 375 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  65.01 
 
 		 347 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  60.17 
 
 		 442 aa  355  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  59.6 
 
 		 379 aa  352  5e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  36.64 
 
 		 416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  39.88 
 
 		 569 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  34.95 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  37.35 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  35.14 
 
 		 419 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  34.56 
 
 		 449 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  35.93 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  34.01 
 
 		 430 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  32.75 
 
 		 593 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000121334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  32.34 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  31.75 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  35 
 
 		 445 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  35.29 
 
 		 445 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  35.98 
 
 		 473 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  35.88 
 
 		 450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  35.14 
 
 		 423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  34.65 
 
 		 473 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  33.42 
 
 		 582 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  36.36 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  35.17 
 
 		 593 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1363  hypothetical protein  35.31 
 
 		 580 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2656  hypothetical protein  33.23 
 
 		 580 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1098  hypothetical protein  33.53 
 
 		 579 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0876  hypothetical protein  34.82 
 
 		 611 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000553707  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  32.11 
 
 		 436 aa  123  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2042  hypothetical protein  32.94 
 
 		 579 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  35.24 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  29.79 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  31.56 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  32.72 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  32.73 
 
 		 360 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  31.79 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  32.03 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  27.95 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  28.52 
 
 		 360 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  28.52 
 
 		 360 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  27.02 
 
 		 352 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  27.55 
 
 		 374 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  27.33 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  28.77 
 
 		 369 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  32.74 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  25.67 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1033  hypothetical protein  26.56 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  28.2 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  24.55 
 
 		 337 aa  89.4  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0904  hypothetical protein  30.51 
 
 		 478 aa  89  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  31.67 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  31.67 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0852  hypothetical protein  30.23 
 
 		 472 aa  88.6  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  29.33 
 
 		 365 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  29.14 
 
 		 348 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  31.33 
 
 		 346 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  24.43 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  28.47 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1452  hypothetical protein  28.2 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  30 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  30.94 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  29.04 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  30.94 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  27.83 
 
 		 352 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  29.1 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  30.62 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  28.29 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  30.62 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  27.91 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  28.29 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  27.91 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  27.91 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  22.95 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  28.29 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1236  hypothetical protein  27.78 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  23.53 
 
 		 341 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  30.29 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  30 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  30 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  29.67 
 
 		 343 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  27.91 
 
 		 340 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  27.85 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  27.15 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  32.24 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  27.74 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  29.74 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  27.78 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  26.46 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  26.75 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  26.88 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2155  hypothetical protein  30.88 
 
 		 473 aa  77  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  29.8 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  28.43 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  30.33 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  28.68 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0966  Uncharacterized protein family UPF0324  29.01 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000478324  hitchhiker  0.0000000801244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  28 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  29.67 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  27.13 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>