237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1628 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  860    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  63.09 
 
 		 375 aa  388  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  64.69 
 
 		 347 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  63.02 
 
 		 379 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  59.24 
 
 		 391 aa  325  8.000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  43.35 
 
 		 569 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  39.88 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  41.54 
 
 		 421 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  40.26 
 
 		 416 aa  217  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  39.43 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  39.31 
 
 		 442 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  37.34 
 
 		 436 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  39.37 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  35.1 
 
 		 582 aa  173  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  34.26 
 
 		 593 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  34.88 
 
 		 434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1363  hypothetical protein  39.69 
 
 		 580 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  34.13 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  33.6 
 
 		 593 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000121334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2656  hypothetical protein  34.83 
 
 		 580 aa  153  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0876  hypothetical protein  32.98 
 
 		 611 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000553707  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1098  hypothetical protein  37.3 
 
 		 579 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  31.11 
 
 		 430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  34.84 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2042  hypothetical protein  36.99 
 
 		 579 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  38.57 
 
 		 445 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  35.1 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  37.76 
 
 		 445 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  37.39 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  34.33 
 
 		 473 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  33.33 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  26.96 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  31.72 
 
 		 374 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  34.04 
 
 		 327 aa  113  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  28.57 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  33.93 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  32.03 
 
 		 360 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  28.71 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  28.39 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  29.94 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  28.91 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1452  hypothetical protein  31.13 
 
 		 498 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  30.86 
 
 		 360 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  32.72 
 
 		 331 aa  99.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0852  hypothetical protein  32.34 
 
 		 472 aa  97.8  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0904  hypothetical protein  33.11 
 
 		 478 aa  97.8  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1236  hypothetical protein  31.42 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1033  hypothetical protein  27.67 
 
 		 480 aa  94  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1188  Uncharacterized protein family UPF0324  28.7 
 
 		 492 aa  93.2  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2155  hypothetical protein  32.09 
 
 		 473 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  29.79 
 
 		 339 aa  89.7  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  24.01 
 
 		 337 aa  87.8  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  29.1 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  26.67 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  27.09 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  26.67 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  25.91 
 
 		 338 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  26.62 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1683  hypothetical protein  31.11 
 
 		 487 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000210217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0966  Uncharacterized protein family UPF0324  27.96 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000478324  hitchhiker  0.0000000801244 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  27.69 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2092  hypothetical protein  27.88 
 
 		 479 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51806  inner membrane protein  26.49 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.959187  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  23.29 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  27.12 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  30 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  25.78 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  29.1 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  28.86 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  23.41 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  25.86 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  29.62 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0247  hypothetical protein  30.19 
 
 		 489 aa  73.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0302693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1977  hypothetical protein  35.37 
 
 		 239 aa  73.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000159953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  29.39 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  27.78 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  24.44 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2603  hypothetical protein  32.2 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.864211  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  26.69 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  25.09 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  24.66 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  30.34 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  27.92 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  25.18 
 
 		 357 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  26.91 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  26.91 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  26.91 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  26.38 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  26.91 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  26.91 
 
 		 349 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  26.91 
 
 		 349 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  26.91 
 
 		 349 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  26.05 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  25.19 
 
 		 372 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  26.91 
 
 		 349 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  26.91 
 
 		 349 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  28.65 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2283  hypothetical protein  26.19 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533884 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  26.91 
 
 		 349 aa  66.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  26.91 
 
 		 349 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>