74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2155 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2155  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  902    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1188  Uncharacterized protein family UPF0324  55.79 
 
 		 492 aa  498  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1033  hypothetical protein  53.15 
 
 		 480 aa  485  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2092  hypothetical protein  53.68 
 
 		 479 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1452  hypothetical protein  52.39 
 
 		 498 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0247  hypothetical protein  49.69 
 
 		 489 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0302693  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0966  Uncharacterized protein family UPF0324  40.59 
 
 		 493 aa  325  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000478324  hitchhiker  0.0000000801244 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0904  hypothetical protein  43.97 
 
 		 478 aa  319  9e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2603  hypothetical protein  41.42 
 
 		 483 aa  317  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.864211  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1683  hypothetical protein  40.17 
 
 		 487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000210217  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0852  hypothetical protein  43.34 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1977  hypothetical protein  61.5 
 
 		 239 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000159953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  31.25 
 
 		 449 aa  151  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  31.69 
 
 		 473 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  32.29 
 
 		 473 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  28.12 
 
 		 419 aa  133  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  29.35 
 
 		 436 aa  129  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  31.32 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  31.96 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  30.63 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  31.42 
 
 		 569 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  30.2 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1236  hypothetical protein  34.48 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  29.86 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  29.1 
 
 		 445 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  31.38 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  31.74 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  32.02 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  28.78 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0348  hypothetical protein  29.94 
 
 		 467 aa  103  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0548273 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  30.2 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0167  hypothetical protein  30.72 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  33.03 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  33.75 
 
 		 375 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  27.61 
 
 		 593 aa  94.4  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000121334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  27.38 
 
 		 593 aa  89.7  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  29.35 
 
 		 436 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  32.09 
 
 		 442 aa  89  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  28.53 
 
 		 582 aa  87.4  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2656  hypothetical protein  27.29 
 
 		 580 aa  86.7  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1363  hypothetical protein  28.46 
 
 		 580 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  31.66 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0876  hypothetical protein  26.97 
 
 		 611 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000553707  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1098  hypothetical protein  26.41 
 
 		 579 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2042  hypothetical protein  26.13 
 
 		 579 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  25.8 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  25.74 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  24.54 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  31.37 
 
 		 391 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  25.57 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  24.63 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  32.29 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  23.53 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  26.67 
 
 		 327 aa  53.9  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  25.98 
 
 		 331 aa  53.1  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  25.63 
 
 		 357 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  21.93 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  26.35 
 
 		 360 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  25.78 
 
 		 360 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  26.32 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0756  hypothetical protein  24.86 
 
 		 331 aa  48.5  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  22.84 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  24.03 
 
 		 343 aa  47.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  25 
 
 		 331 aa  47.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  26.71 
 
 		 338 aa  47.4  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  26.44 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  24.16 
 
 		 355 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1017  hypothetical protein  22.19 
 
 		 365 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0028722  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  28.57 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  22.19 
 
 		 365 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  27.1 
 
 		 361 aa  43.9  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0127  hypothetical protein  23.66 
 
 		 339 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51806  inner membrane protein  23.3 
 
 		 441 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.959187  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  25.19 
 
 		 348 aa  43.9  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>