246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2085 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  813    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  73.91 
 
 		 419 aa  609  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  67.79 
 
 		 421 aa  552  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  55.07 
 
 		 416 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  51.22 
 
 		 569 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  36.34 
 
 		 593 aa  216  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  35.77 
 
 		 442 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  37.12 
 
 		 436 aa  210  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  41.87 
 
 		 379 aa  209  9e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  36.13 
 
 		 430 aa  206  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  40.58 
 
 		 442 aa  203  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  35.79 
 
 		 593 aa  200  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000121334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  32.15 
 
 		 436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  35.62 
 
 		 582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2656  hypothetical protein  36.56 
 
 		 580 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0876  hypothetical protein  36.63 
 
 		 611 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000553707  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1363  hypothetical protein  38.23 
 
 		 580 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  38.22 
 
 		 347 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  33.1 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1098  hypothetical protein  38.06 
 
 		 579 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2042  hypothetical protein  37.22 
 
 		 579 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  36.08 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  31.41 
 
 		 445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  31.12 
 
 		 445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  30.85 
 
 		 473 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  29.07 
 
 		 434 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  32.45 
 
 		 390 aa  156  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  30.53 
 
 		 473 aa  156  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  37.02 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  30.46 
 
 		 445 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  31.78 
 
 		 423 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  31.83 
 
 		 450 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1452  hypothetical protein  29.35 
 
 		 498 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1188  Uncharacterized protein family UPF0324  28.22 
 
 		 492 aa  127  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2155  hypothetical protein  28.18 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  29.81 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  24.76 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0852  hypothetical protein  29.03 
 
 		 472 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0247  hypothetical protein  27.69 
 
 		 489 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0302693  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1033  hypothetical protein  27.32 
 
 		 480 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1236  hypothetical protein  27.93 
 
 		 348 aa  109  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2092  hypothetical protein  25.9 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  26.52 
 
 		 369 aa  106  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  24.64 
 
 		 357 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0904  hypothetical protein  27.77 
 
 		 478 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  27.64 
 
 		 369 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  27.62 
 
 		 355 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2603  hypothetical protein  27.57 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.864211  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1683  hypothetical protein  31.35 
 
 		 487 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000210217  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  25.56 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  28.87 
 
 		 327 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  25.45 
 
 		 360 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  24.73 
 
 		 355 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  24.59 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  27 
 
 		 360 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0966  Uncharacterized protein family UPF0324  24.95 
 
 		 493 aa  93.2  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000478324  hitchhiker  0.0000000801244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  25.87 
 
 		 360 aa  92.8  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  25.87 
 
 		 360 aa  92.8  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  26.95 
 
 		 324 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  23.61 
 
 		 354 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  25.45 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  26.86 
 
 		 335 aa  90.5  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  24.82 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  27.56 
 
 		 348 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  25.96 
 
 		 339 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0167  hypothetical protein  26.37 
 
 		 467 aa  88.6  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0348  hypothetical protein  27.03 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0548273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1977  hypothetical protein  32.83 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000159953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  23.32 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  24.02 
 
 		 365 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  22.15 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1017  hypothetical protein  23.72 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0028722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  23.84 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  23.27 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  25.38 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  25.26 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  24.14 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  28.25 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  25.99 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  25.99 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  25.99 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  25.99 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  24.5 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  24.66 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  25.89 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  29.48 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  23.46 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  26.09 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  25.27 
 
 		 352 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0756  hypothetical protein  25.73 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  25.45 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  25.67 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  23.97 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  29.38 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  27.08 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  25.27 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 573 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  26.41 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  24.83 
 
 		 335 aa  72.8  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  24.5 
 
 		 340 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>