183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3021 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  915    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  86.89 
 
 		 473 aa  784    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  46.64 
 
 		 449 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  49.1 
 
 		 445 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  48.64 
 
 		 445 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  48.64 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  44.78 
 
 		 450 aa  329  7e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  40.77 
 
 		 436 aa  289  7e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  38.82 
 
 		 442 aa  269  8e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  37.44 
 
 		 423 aa  229  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  34.01 
 
 		 434 aa  207  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  30.02 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  31.13 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  29.08 
 
 		 436 aa  162  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  27.52 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  28.73 
 
 		 430 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  33.23 
 
 		 569 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  37.94 
 
 		 379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  31.85 
 
 		 593 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  30.31 
 
 		 416 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2656  hypothetical protein  29.9 
 
 		 580 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  36.42 
 
 		 375 aa  142  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1188  Uncharacterized protein family UPF0324  29.78 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  35.23 
 
 		 347 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0876  hypothetical protein  31.28 
 
 		 611 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000553707  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2155  hypothetical protein  31.69 
 
 		 473 aa  136  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  36.04 
 
 		 442 aa  133  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1452  hypothetical protein  27.77 
 
 		 498 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1098  hypothetical protein  30.56 
 
 		 579 aa  131  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  27.62 
 
 		 582 aa  127  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0904  hypothetical protein  28.6 
 
 		 478 aa  126  7e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1363  hypothetical protein  29.11 
 
 		 580 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  31.11 
 
 		 390 aa  123  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2042  hypothetical protein  29.29 
 
 		 579 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1033  hypothetical protein  26.97 
 
 		 480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  35.33 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0852  hypothetical protein  30.15 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0247  hypothetical protein  28.7 
 
 		 489 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0302693  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  30.1 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0966  Uncharacterized protein family UPF0324  26.94 
 
 		 493 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000478324  hitchhiker  0.0000000801244 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2603  hypothetical protein  28.02 
 
 		 483 aa  110  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.864211  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2092  hypothetical protein  28.54 
 
 		 479 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1683  hypothetical protein  27.81 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000210217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  26.8 
 
 		 593 aa  107  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000121334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  31.27 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  30.67 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  26.81 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1236  hypothetical protein  32.68 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  26.99 
 
 		 374 aa  86.7  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  26.56 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  27.3 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  27.71 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  27.99 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0348  hypothetical protein  28.13 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0548273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1977  hypothetical protein  34.08 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000159953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  27.03 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  26.48 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0167  hypothetical protein  28.78 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  23.29 
 
 		 337 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  24.59 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  27.1 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  25.24 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  27 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  24.67 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  26.92 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  24.44 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  24.44 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  27.61 
 
 		 327 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  22.74 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  27.84 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  23.43 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  23.05 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  21.22 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  23.85 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  23.62 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  26.27 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  21.45 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  23.28 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  25.55 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  23.57 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  29.29 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05460  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00698  29.24 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000315595  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  24.93 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  23.12 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  25.24 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  24.85 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  24.08 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  26.2 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1017  hypothetical protein  24.85 
 
 		 365 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0028722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  25.17 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  24.66 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  22.08 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  25.1 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  32.41 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  24.34 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3868  hypothetical protein  24.5 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  24.9 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  23.55 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  24.66 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  24.15 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>