72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1236 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1236  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  672    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0348  hypothetical protein  80.8 
 
 
467 aa  490  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0548273 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0167  hypothetical protein  80.23 
 
 
467 aa  481  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1188  Uncharacterized protein family UPF0324  34.07 
 
 
492 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0904  hypothetical protein  38.48 
 
 
478 aa  156  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1452  hypothetical protein  33.7 
 
 
498 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0852  hypothetical protein  37.01 
 
 
472 aa  139  7e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1033  hypothetical protein  31.1 
 
 
480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0247  hypothetical protein  32.51 
 
 
489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0302693  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1683  hypothetical protein  38.7 
 
 
487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000210217  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2092  hypothetical protein  34.55 
 
 
479 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  34.33 
 
 
416 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  33.2 
 
 
569 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2603  hypothetical protein  38.14 
 
 
483 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.864211  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0966  Uncharacterized protein family UPF0324  36.03 
 
 
493 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000478324  hitchhiker  0.0000000801244 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  29.82 
 
 
421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1977  hypothetical protein  40.44 
 
 
239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000159953  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  30.19 
 
 
449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  27.93 
 
 
418 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2155  hypothetical protein  34.48 
 
 
473 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  29.03 
 
 
419 aa  106  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  31.85 
 
 
593 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000121334  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  36.33 
 
 
379 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  31.37 
 
 
593 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  30.25 
 
 
436 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2656  hypothetical protein  29.25 
 
 
580 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  32.23 
 
 
436 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  34.41 
 
 
390 aa  95.9  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  31.87 
 
 
582 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  32.08 
 
 
473 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  30.03 
 
 
442 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1363  hypothetical protein  30.8 
 
 
580 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  28.92 
 
 
434 aa  90.1  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  28.57 
 
 
445 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  30.12 
 
 
445 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  31.32 
 
 
473 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0876  hypothetical protein  26.65 
 
 
611 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000553707  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  29.89 
 
 
430 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1098  hypothetical protein  29.64 
 
 
579 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  27.19 
 
 
450 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  31.42 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  27.57 
 
 
445 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2042  hypothetical protein  29.79 
 
 
579 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  32.07 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  31.43 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  30.04 
 
 
423 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  25.1 
 
 
352 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  26.16 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
573 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  27.38 
 
 
391 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  26.38 
 
 
331 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  30.29 
 
 
347 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  24.42 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  24.67 
 
 
374 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2130  hypothetical protein  32.41 
 
 
374 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000290153  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  26.09 
 
 
411 aa  46.2  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  25.42 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  26.29 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  25.85 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  25.85 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  25.85 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  25.85 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  25.85 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  25.85 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  25.85 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  25.85 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  25.85 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  22.36 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  21.83 
 
 
359 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  22.36 
 
 
322 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  26.26 
 
 
361 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  30.08 
 
 
348 aa  42.7  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>