202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3343 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  95.96 
 
 
445 aa  784    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  857    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  98.88 
 
 
445 aa  850    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  55.2 
 
 
449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  50.81 
 
 
450 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  49.1 
 
 
473 aa  359  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  48.64 
 
 
473 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  41.9 
 
 
436 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  41.36 
 
 
442 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  38.41 
 
 
434 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  40.38 
 
 
423 aa  229  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  37.97 
 
 
569 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  33.8 
 
 
419 aa  170  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  31.41 
 
 
418 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  35.54 
 
 
416 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  40.12 
 
 
375 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  32.66 
 
 
421 aa  159  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  39.04 
 
 
379 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  29.36 
 
 
430 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  31.87 
 
 
436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2656  hypothetical protein  31.85 
 
 
580 aa  146  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  32.22 
 
 
593 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1363  hypothetical protein  32.97 
 
 
580 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0876  hypothetical protein  31.01 
 
 
611 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000553707  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1098  hypothetical protein  32.49 
 
 
579 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  35.69 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  32.01 
 
 
582 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1188  Uncharacterized protein family UPF0324  29.81 
 
 
492 aa  133  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2042  hypothetical protein  30.99 
 
 
579 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  37.76 
 
 
442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0852  hypothetical protein  29.75 
 
 
472 aa  129  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  37.04 
 
 
391 aa  128  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0904  hypothetical protein  31.19 
 
 
478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1452  hypothetical protein  30.26 
 
 
498 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0966  Uncharacterized protein family UPF0324  31.62 
 
 
493 aa  124  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000478324  hitchhiker  0.0000000801244 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  32.57 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  29.57 
 
 
593 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000121334  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1033  hypothetical protein  29.46 
 
 
480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1683  hypothetical protein  32.1 
 
 
487 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000210217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0247  hypothetical protein  30.53 
 
 
489 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0302693  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2155  hypothetical protein  30.85 
 
 
473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2092  hypothetical protein  29.18 
 
 
479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  31.02 
 
 
334 aa  109  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2603  hypothetical protein  30.36 
 
 
483 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.864211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  29.41 
 
 
357 aa  103  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  30.52 
 
 
331 aa  99.8  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  27.57 
 
 
337 aa  99.8  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1236  hypothetical protein  30.89 
 
 
348 aa  97.1  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1977  hypothetical protein  38.74 
 
 
239 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000159953  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  30.52 
 
 
352 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  29.47 
 
 
360 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  30.62 
 
 
348 aa  93.6  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0348  hypothetical protein  30.27 
 
 
467 aa  90.9  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0548273 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0167  hypothetical protein  29.97 
 
 
467 aa  90.1  8e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  29.07 
 
 
360 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  29.93 
 
 
327 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  28.52 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  27.12 
 
 
369 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  26.67 
 
 
369 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  25.75 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  28.57 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  23.97 
 
 
335 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  26.1 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  26.1 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  26.79 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  27.89 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  28.83 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  24.36 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  23.13 
 
 
335 aa  67  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  29.48 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  26.02 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  27.44 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  25.59 
 
 
329 aa  64.3  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  23.25 
 
 
340 aa  63.2  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  28.19 
 
 
352 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  23.82 
 
 
340 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  25.81 
 
 
340 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  24.17 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  32.76 
 
 
348 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  24.55 
 
 
352 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  24.55 
 
 
340 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  24.75 
 
 
335 aa  61.6  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  23.51 
 
 
340 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  27.3 
 
 
356 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  24.55 
 
 
352 aa  61.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  22.68 
 
 
338 aa  60.8  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  27.48 
 
 
362 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  24.55 
 
 
340 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  27.63 
 
 
324 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  24.55 
 
 
352 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  24.55 
 
 
340 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  31.21 
 
 
349 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  27.67 
 
 
356 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  31.21 
 
 
349 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  31.21 
 
 
349 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  31.21 
 
 
349 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  28.66 
 
 
350 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  30.06 
 
 
349 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  30.06 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  30.06 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>