207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2042 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2656  hypothetical protein  64.01 
 
 		 580 aa  680    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0876  hypothetical protein  68.79 
 
 		 611 aa  715    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000553707  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1363  hypothetical protein  81.55 
 
 		 580 aa  824    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1098  hypothetical protein  88.77 
 
 		 579 aa  958    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2042  hypothetical protein  100 
 
 		 579 aa  1164    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  60.14 
 
 		 582 aa  630  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  58.79 
 
 		 593 aa  612  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  46.76 
 
 		 593 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000121334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  48.81 
 
 		 436 aa  320  5e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  45.68 
 
 		 430 aa  320  7e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  38.66 
 
 		 569 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  39.66 
 
 		 416 aa  227  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  37.4 
 
 		 418 aa  210  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  35.46 
 
 		 419 aa  206  8e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  38.78 
 
 		 421 aa  206  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  37.38 
 
 		 442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  31.5 
 
 		 442 aa  164  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  38.28 
 
 		 379 aa  161  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  29.68 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  31.27 
 
 		 445 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  30.99 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  30.05 
 
 		 436 aa  151  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  31.49 
 
 		 434 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  31.09 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  36.36 
 
 		 347 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  35.81 
 
 		 375 aa  141  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  29.29 
 
 		 473 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  33.03 
 
 		 423 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2092  hypothetical protein  28.71 
 
 		 479 aa  134  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  28.53 
 
 		 473 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  32.79 
 
 		 390 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1188  Uncharacterized protein family UPF0324  26.86 
 
 		 492 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  31.7 
 
 		 450 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1683  hypothetical protein  30.98 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000210217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1452  hypothetical protein  26.7 
 
 		 498 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  31.91 
 
 		 334 aa  120  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1033  hypothetical protein  27.62 
 
 		 480 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2603  hypothetical protein  30.28 
 
 		 483 aa  116  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.864211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  34.45 
 
 		 391 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0966  Uncharacterized protein family UPF0324  25.12 
 
 		 493 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000478324  hitchhiker  0.0000000801244 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0904  hypothetical protein  29.78 
 
 		 478 aa  110  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  29.19 
 
 		 352 aa  101  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0247  hypothetical protein  28.25 
 
 		 489 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0302693  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1236  hypothetical protein  30.43 
 
 		 348 aa  98.2  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  27 
 
 		 357 aa  97.4  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0852  hypothetical protein  26.98 
 
 		 472 aa  95.5  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  29.33 
 
 		 331 aa  95.1  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  28.88 
 
 		 327 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  29.18 
 
 		 360 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  27.33 
 
 		 355 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  29.69 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0167  hypothetical protein  27.69 
 
 		 467 aa  83.2  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  28.21 
 
 		 374 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2155  hypothetical protein  27.22 
 
 		 473 aa  83.2  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0348  hypothetical protein  27.24 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0548273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  30.79 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  30.22 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  27.76 
 
 		 360 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  25.33 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  27.89 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  25.57 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  25.57 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  25.21 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  27.27 
 
 		 339 aa  76.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  25.83 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  27.65 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  24.52 
 
 		 357 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  22.76 
 
 		 343 aa  73.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  24.84 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  25.85 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1977  hypothetical protein  28.8 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000159953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  23.6 
 
 		 368 aa  72  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0756  hypothetical protein  26.77 
 
 		 331 aa  70.1  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  23.67 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  25.59 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  26.77 
 
 		 324 aa  67  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  27.03 
 
 		 331 aa  66.6  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  23.81 
 
 		 340 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  25.59 
 
 		 340 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  23.77 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  22.09 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 573 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1017  hypothetical protein  23.5 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0028722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  23.96 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  24.21 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  26.34 
 
 		 360 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  25.96 
 
 		 340 aa  63.2  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0127  hypothetical protein  23.26 
 
 		 339 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  26.34 
 
 		 360 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2241  hypothetical protein  24.64 
 
 		 361 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  23.46 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  31.62 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  24.5 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  24.5 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  24.5 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  24.5 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  22.95 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  24.83 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  24.5 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>