247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0334 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  856    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  44.39 
 
 
430 aa  363  5.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  52.36 
 
 
593 aa  359  4e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1363  hypothetical protein  51.19 
 
 
580 aa  340  4e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1098  hypothetical protein  50.66 
 
 
579 aa  328  9e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2656  hypothetical protein  49.87 
 
 
580 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0876  hypothetical protein  48.54 
 
 
611 aa  316  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000553707  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  47.76 
 
 
582 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2042  hypothetical protein  48.81 
 
 
579 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  44.59 
 
 
593 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000121334  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  38.3 
 
 
419 aa  246  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  38.31 
 
 
416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  39.72 
 
 
418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  35.71 
 
 
421 aa  232  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  42.32 
 
 
569 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  29.93 
 
 
449 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  31.32 
 
 
473 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  30.8 
 
 
473 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  33.17 
 
 
442 aa  176  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  30.37 
 
 
436 aa  173  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  31.87 
 
 
445 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  31.87 
 
 
445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  37.71 
 
 
379 aa  164  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1188  Uncharacterized protein family UPF0324  30.72 
 
 
492 aa  163  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  32.94 
 
 
450 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  32.82 
 
 
434 aa  161  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  32.23 
 
 
445 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  34.89 
 
 
423 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  34.71 
 
 
390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  34.57 
 
 
375 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  33.33 
 
 
442 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  35.24 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0348  hypothetical protein  31.82 
 
 
467 aa  131  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0548273 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1683  hypothetical protein  29.35 
 
 
487 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000210217  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0167  hypothetical protein  31.59 
 
 
467 aa  127  6e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  29.94 
 
 
334 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0904  hypothetical protein  30.35 
 
 
478 aa  125  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  31 
 
 
327 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0852  hypothetical protein  30.72 
 
 
472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1236  hypothetical protein  32.23 
 
 
348 aa  121  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2603  hypothetical protein  29.61 
 
 
483 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.864211  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2092  hypothetical protein  29.62 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1452  hypothetical protein  27.18 
 
 
498 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0966  Uncharacterized protein family UPF0324  28.02 
 
 
493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000478324  hitchhiker  0.0000000801244 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  27.98 
 
 
352 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1033  hypothetical protein  28.9 
 
 
480 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  32.34 
 
 
391 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0247  hypothetical protein  26.8 
 
 
489 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0302693  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  27.65 
 
 
354 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  28.1 
 
 
357 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  28.78 
 
 
331 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  31.49 
 
 
348 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2155  hypothetical protein  28.78 
 
 
473 aa  103  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  27.54 
 
 
369 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  26.45 
 
 
352 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  27.48 
 
 
348 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  27.04 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  29.35 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  25.74 
 
 
357 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  29.08 
 
 
360 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  26.43 
 
 
360 aa  92.8  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  26.43 
 
 
360 aa  92.8  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  26.96 
 
 
355 aa  90.9  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  26.14 
 
 
369 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  28.28 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  28.32 
 
 
411 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  26.89 
 
 
338 aa  87.4  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  27.78 
 
 
339 aa  87  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  27.01 
 
 
369 aa  87  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  25.59 
 
 
335 aa  87  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  27.63 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  23.67 
 
 
340 aa  86.3  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  23.3 
 
 
359 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  27.36 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  24.29 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  25.97 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  27.42 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  25.16 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2241  hypothetical protein  25.16 
 
 
361 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  26.03 
 
 
343 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  23.89 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  24.62 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  27.3 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  22.91 
 
 
355 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  24.23 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  24.7 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  24.7 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  24.7 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0153  hypothetical protein  27.44 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4024  hypothetical protein  30.03 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.819809 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0756  hypothetical protein  27.83 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  24.75 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  24.83 
 
 
340 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  24.78 
 
 
331 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  24.75 
 
 
363 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  23.73 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  23.73 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  23.73 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  23.73 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  23.73 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>