89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0904 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0852  hypothetical protein  83.65 
 
 
472 aa  731    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0904  hypothetical protein  100 
 
 
478 aa  918    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1188  Uncharacterized protein family UPF0324  52.75 
 
 
492 aa  435  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1452  hypothetical protein  45.11 
 
 
498 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2092  hypothetical protein  44.72 
 
 
479 aa  351  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0247  hypothetical protein  44.76 
 
 
489 aa  341  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0302693  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1033  hypothetical protein  41.61 
 
 
480 aa  329  8e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2155  hypothetical protein  43.97 
 
 
473 aa  319  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0966  Uncharacterized protein family UPF0324  40.25 
 
 
493 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000478324  hitchhiker  0.0000000801244 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1683  hypothetical protein  41.24 
 
 
487 aa  296  6e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000210217  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2603  hypothetical protein  41.13 
 
 
483 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.864211  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0167  hypothetical protein  38.26 
 
 
467 aa  210  4e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0348  hypothetical protein  37.25 
 
 
467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0548273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1977  hypothetical protein  51.8 
 
 
239 aa  199  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000159953  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  34.99 
 
 
449 aa  179  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1236  hypothetical protein  38.48 
 
 
348 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  30.51 
 
 
436 aa  147  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  34.17 
 
 
450 aa  146  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  31.5 
 
 
442 aa  144  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  30.68 
 
 
416 aa  136  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  30.16 
 
 
473 aa  136  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  29.52 
 
 
569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  28.93 
 
 
473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  31.19 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  31.19 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  28.04 
 
 
419 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  32.75 
 
 
582 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2656  hypothetical protein  30.32 
 
 
580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  28.15 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  25.82 
 
 
434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  28 
 
 
430 aa  113  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  27.57 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  30.64 
 
 
436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  29.2 
 
 
445 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  34.02 
 
 
375 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0876  hypothetical protein  29.78 
 
 
611 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000553707  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  29.22 
 
 
593 aa  103  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1098  hypothetical protein  29.46 
 
 
579 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  28.66 
 
 
423 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  34.15 
 
 
379 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  33.11 
 
 
442 aa  96.7  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  34.03 
 
 
347 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2042  hypothetical protein  29.3 
 
 
579 aa  94  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  28.64 
 
 
593 aa  94  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000121334  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1363  hypothetical protein  31.45 
 
 
580 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  30.46 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  29.43 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  26.4 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  26.95 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  27.08 
 
 
331 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  26.44 
 
 
355 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  25.78 
 
 
374 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  23.24 
 
 
337 aa  62.4  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  24.44 
 
 
357 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  25.63 
 
 
360 aa  60.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  24.58 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  25.25 
 
 
340 aa  57.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  24.16 
 
 
352 aa  57  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  25.93 
 
 
339 aa  53.5  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  25.55 
 
 
360 aa  53.5  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  26.45 
 
 
369 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  51.2  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  21.49 
 
 
357 aa  50.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  28.3 
 
 
331 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1432  hypothetical protein  29.37 
 
 
342 aa  49.3  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  23.95 
 
 
369 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  25.64 
 
 
331 aa  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0756  hypothetical protein  28.26 
 
 
331 aa  47.8  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3868  hypothetical protein  24.88 
 
 
316 aa  47.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  24.27 
 
 
346 aa  47.4  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  25.65 
 
 
338 aa  47  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  24.88 
 
 
316 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  24.46 
 
 
343 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  24.38 
 
 
316 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0104  hypothetical protein  24.38 
 
 
316 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4296  hypothetical protein  24.38 
 
 
316 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  25.93 
 
 
327 aa  45.8  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  27.72 
 
 
327 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  22.92 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0848  hypothetical protein  24.25 
 
 
338 aa  45.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  24.65 
 
 
360 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  24.65 
 
 
360 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  24.76 
 
 
316 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  24.05 
 
 
340 aa  44.3  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  23.08 
 
 
341 aa  43.9  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  21.69 
 
 
359 aa  43.5  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  26.34 
 
 
313 aa  43.1  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>