More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4213 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4213  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 551 aa  1054    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4215  amino acid adenylation domain protein  53.24 
 
 		 547 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03108  hypothetical protein  47.05 
 
 		 551 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3662  amino acid adenylation domain protein  42.22 
 
 		 543 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0562  BarD  32.59 
 
 		 565 aa  199  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276524  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2462  amino acid adenylation domain-containing protein  32.37 
 
 		 529 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0899  BarD  32.44 
 
 		 602 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2598  amino acid adenylation domain-containing protein  32.14 
 
 		 529 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3493  hypothetical protein  29.06 
 
 		 523 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0647541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  29.61 
 
 		 5422 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  30.86 
 
 		 2201 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3578  amino acid adenylation domain protein  34.47 
 
 		 2098 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.341222  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10576  conserved hypothetical protein  28.97 
 
 		 1704 aa  141  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.474495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0174  amino acid adenylation  29.2 
 
 		 1332 aa  140  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4340  non-ribosomal peptide synthetase  29.13 
 
 		 1360 aa  140  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34953  normal  0.731167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  28.71 
 
 		 4882 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  29.89 
 
 		 3018 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  30.59 
 
 		 7785 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  28.26 
 
 		 2573 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  27.17 
 
 		 2571 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  27.17 
 
 		 2571 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5328  amino acid adenylation domain-containing protein  28.78 
 
 		 1351 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.082468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  27.07 
 
 		 9175 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  28.07 
 
 		 2625 aa  134  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  27.01 
 
 		 2666 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  27.07 
 
 		 6202 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6051  amino acid adenylation domain-containing protein  29.7 
 
 		 500 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0828298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3972  non-ribosomal peptide synthetase  28.66 
 
 		 1368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  26.65 
 
 		 1553 aa  133  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6557  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.86 
 
 		 2320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000475071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4452  non-ribosomal peptide synthetase  27.65 
 
 		 1395 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270452  normal  0.260871 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  30.77 
 
 		 5953 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  24.28 
 
 		 2033 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  29.93 
 
 		 1734 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  29.79 
 
 		 1498 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2492  amino acid adenylation domain protein  31.81 
 
 		 590 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  26.3 
 
 		 2596 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3891  amino acid adenylation domain protein  28.41 
 
 		 1256 aa  130  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  28.48 
 
 		 3335 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  25.6 
 
 		 2176 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5851  amino acid adenylation domain protein  28.63 
 
 		 1343 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877772  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  29.15 
 
 		 1314 aa  128  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3479  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1279 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.165023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.2 
 
 		 1806 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0342  amino acid adenylation domain-containing protein  28.46 
 
 		 579 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  26.68 
 
 		 6676 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  28.25 
 
 		 1127 aa  127  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2201  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  30.69 
 
 		 2106 aa  127  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  25.29 
 
 		 1317 aa  126  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  28.12 
 
 		 3291 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  29.78 
 
 		 7310 aa  126  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  31.26 
 
 		 2023 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3427  enterobactin synthase subunit F  27.08 
 
 		 1325 aa  126  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168919  normal  0.066928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  29.73 
 
 		 4106 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  29.36 
 
 		 1825 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3477  amino acid adenylation domain-containing protein  28.43 
 
 		 1745 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0634623  normal  0.144372 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  29.65 
 
 		 1825 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  29.36 
 
 		 1825 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3845  amino acid adenylation domain-containing protein  29.08 
 
 		 1721 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2723  amino acid adenylation domain protein  29.58 
 
 		 591 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  27.8 
 
 		 4572 aa  125  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  28.35 
 
 		 1152 aa  125  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  29.59 
 
 		 2350 aa  125  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  27.42 
 
 		 3293 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20780  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  28.85 
 
 		 3539 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.040794 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  31.29 
 
 		 2084 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  28.78 
 
 		 2258 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4589  amino acid adenylation domain protein  30.56 
 
 		 3681 aa  124  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  27.96 
 
 		 6889 aa  124  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  31.26 
 
 		 2090 aa  124  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02545  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  23.15 
 
 		 6919 aa  123  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  24.19 
 
 		 541 aa  123  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0252  D-alanine-activating enzyme  24.2 
 
 		 508 aa  123  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  29.09 
 
 		 7712 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  26.53 
 
 		 4531 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  28.01 
 
 		 6006 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  27.76 
 
 		 5328 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  29.47 
 
 		 2365 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  32.63 
 
 		 1163 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  27.37 
 
 		 3875 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  27.59 
 
 		 4468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  27.36 
 
 		 2845 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1002  non-ribosomal peptide synthetase  26.06 
 
 		 1358 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0203382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  29.57 
 
 		 1824 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1226  peptide synthetase, putative  27.29 
 
 		 548 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0632  amino acid adenylation domain protein  30.75 
 
 		 1479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  31.31 
 
 		 8211 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  29.81 
 
 		 6176 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  24.5 
 
 		 1753 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  29.78 
 
 		 5213 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  30.66 
 
 		 1894 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0576  amino acid adenylation domain protein  26.49 
 
 		 503 aa  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3466  amino acid adenylation  28.03 
 
 		 1745 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3529  amino acid adenylation domain-containing protein  28.03 
 
 		 1745 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  31.57 
 
 		 2250 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0443  linear gramicidin synthetase subunit C  21.4 
 
 		 1193 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  27.92 
 
 		 9498 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2725  amino acid adenylation domain-containing protein  27.86 
 
 		 588 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0175538  normal  0.742433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  28.01 
 
 		 4090 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0631  amino acid adenylation domain protein  28.16 
 
 		 1529 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>