More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3891 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  39.54 
 
 		 5953 aa  672    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  41.71 
 
 		 6889 aa  674    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  37.49 
 
 		 6661 aa  666    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  38.74 
 
 		 4531 aa  689    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  39.73 
 
 		 3328 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  39.73 
 
 		 6081 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  41.37 
 
 		 3021 aa  689    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  40.54 
 
 		 1370 aa  821    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  38.78 
 
 		 6676 aa  689    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  34.65 
 
 		 3291 aa  663    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  40.66 
 
 		 2370 aa  688    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  39.68 
 
 		 6072 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  39.4 
 
 		 3291 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  42.61 
 
 		 3002 aa  706    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  41.78 
 
 		 1369 aa  840    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  39.79 
 
 		 3348 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  42.35 
 
 		 8646 aa  673    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  39.73 
 
 		 3352 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  43.46 
 
 		 4383 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  39.73 
 
 		 6006 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3891  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 		 1256 aa  2466    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  38.99 
 
 		 6403 aa  635  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  40.72 
 
 		 5372 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  38.22 
 
 		 4960 aa  634  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  34.22 
 
 		 1556 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  39.34 
 
 		 9498 aa  629  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  38.07 
 
 		 13537 aa  628  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  37.09 
 
 		 3498 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  39.86 
 
 		 4882 aa  627  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  33.41 
 
 		 2386 aa  624  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  40.36 
 
 		 5929 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  36.68 
 
 		 3432 aa  625  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  40.92 
 
 		 2187 aa  623  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  39.25 
 
 		 4572 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  33.93 
 
 		 1556 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  38.97 
 
 		 4468 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  39.79 
 
 		 5926 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  37.57 
 
 		 4960 aa  621  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  37.27 
 
 		 4968 aa  616  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  33.11 
 
 		 3086 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  40.2 
 
 		 8914 aa  618  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  33.11 
 
 		 3086 aa  615  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  35.28 
 
 		 2156 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  37.07 
 
 		 2033 aa  613  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  35.2 
 
 		 2156 aa  616  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  37.09 
 
 		 3308 aa  611  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  34.65 
 
 		 2156 aa  609  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.17 
 
 		 2385 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.14 
 
 		 2385 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  35.23 
 
 		 2385 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  39.44 
 
 		 4136 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.78 
 
 		 2385 aa  602  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.67 
 
 		 2385 aa  601  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.78 
 
 		 2385 aa  602  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  37.36 
 
 		 2448 aa  601  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  40.15 
 
 		 8915 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  38.09 
 
 		 2151 aa  598  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  34.59 
 
 		 2385 aa  598  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  37.67 
 
 		 4502 aa  596  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.75 
 
 		 2385 aa  599  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  34.01 
 
 		 1816 aa  598  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.95 
 
 		 2385 aa  599  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  38.86 
 
 		 5149 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  34.78 
 
 		 2386 aa  592  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  37.2 
 
 		 7712 aa  591  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  30.66 
 
 		 1833 aa  590  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  41.65 
 
 		 8211 aa  586  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  39.41 
 
 		 5328 aa  589  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  35.19 
 
 		 2006 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  33.4 
 
 		 2054 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  38.82 
 
 		 4747 aa  585  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  38.41 
 
 		 2154 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  37.24 
 
 		 4489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  34.26 
 
 		 1550 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  35.97 
 
 		 2867 aa  581  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  38.6 
 
 		 3639 aa  580  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  35.86 
 
 		 2395 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  35.12 
 
 		 1569 aa  577  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  35.68 
 
 		 2664 aa  579  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.45 
 
 		 1839 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  35.68 
 
 		 2395 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  35.76 
 
 		 5596 aa  575  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  42.23 
 
 		 7541 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  38.4 
 
 		 5213 aa  574  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  36.1 
 
 		 2419 aa  572  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  34.95 
 
 		 5738 aa  571  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  38.9 
 
 		 3710 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  38.45 
 
 		 3942 aa  572  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  39.09 
 
 		 7310 aa  567  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  36.41 
 
 		 3824 aa  569  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  33.21 
 
 		 2193 aa  569  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  39.1 
 
 		 2189 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  40.04 
 
 		 3247 aa  565  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.28 
 
 		 2720 aa  561  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  34.07 
 
 		 1383 aa  561  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  33.14 
 
 		 3235 aa  560  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  36.71 
 
 		 1829 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  37.88 
 
 		 2201 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  35.29 
 
 		 7785 aa  558  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1971  amino acid adenylation domain-containing protein  38.93 
 
 		 1109 aa  559  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.353817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>