More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03108 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03108  hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1119    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4215  amino acid adenylation domain protein  59.43 
 
 		 547 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3662  amino acid adenylation domain protein  52.95 
 
 		 543 aa  531  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4213  AMP-dependent synthetase and ligase  46.49 
 
 		 551 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0562  BarD  36.47 
 
 		 565 aa  287  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276524  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2462  amino acid adenylation domain-containing protein  36.47 
 
 		 529 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2598  amino acid adenylation domain-containing protein  36.27 
 
 		 529 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0899  BarD  36.35 
 
 		 602 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3493  hypothetical protein  34.17 
 
 		 523 aa  280  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0647541 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  30.86 
 
 		 2176 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  31.29 
 
 		 9175 aa  210  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1002  non-ribosomal peptide synthetase  32.84 
 
 		 1358 aa  206  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0203382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  30.9 
 
 		 6202 aa  206  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  31.98 
 
 		 9498 aa  204  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  31.97 
 
 		 5422 aa  200  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1102  non-ribosomal peptide synthetase  31.55 
 
 		 1345 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0166801  normal  0.534477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  31.63 
 
 		 13537 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  32.09 
 
 		 4882 aa  198  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  33.65 
 
 		 3942 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0174  amino acid adenylation  32.56 
 
 		 1332 aa  196  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  30.8 
 
 		 5596 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  29.71 
 
 		 2033 aa  194  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  32.02 
 
 		 5926 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1084  non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins-like protein  29.28 
 
 		 2638 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  32.33 
 
 		 3018 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  28.28 
 
 		 7168 aa  191  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4662  amino acid adenylation  30.43 
 
 		 1346 aa  189  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  32.87 
 
 		 2201 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  32.45 
 
 		 2365 aa  189  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3477  amino acid adenylation domain-containing protein  32.94 
 
 		 1745 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0634623  normal  0.144372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  31.06 
 
 		 3168 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  30.89 
 
 		 6176 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  30.75 
 
 		 1317 aa  189  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5851  amino acid adenylation domain protein  31.75 
 
 		 1343 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877772  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  30.13 
 
 		 5738 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.84 
 
 		 4968 aa  187  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1177  amino acid adenylation  29.8 
 
 		 3137 aa  187  5e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5328  amino acid adenylation domain-containing protein  32.48 
 
 		 1351 aa  186  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.082468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  34.1 
 
 		 7785 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  30.89 
 
 		 5929 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.88 
 
 		 8646 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  31.2 
 
 		 4747 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  31.97 
 
 		 6676 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3466  amino acid adenylation  32.55 
 
 		 1745 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3529  amino acid adenylation domain-containing protein  32.55 
 
 		 1745 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  32.08 
 
 		 1779 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  31.83 
 
 		 4383 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  29.78 
 
 		 1528 aa  183  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  31.55 
 
 		 8915 aa  183  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4340  non-ribosomal peptide synthetase  31.78 
 
 		 1360 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34953  normal  0.731167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3891  amino acid adenylation domain protein  31.59 
 
 		 1256 aa  183  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3479  hypothetical protein  32.02 
 
 		 1279 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.165023 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  33.46 
 
 		 3328 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  30.67 
 
 		 1483 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  33.46 
 
 		 6081 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3972  non-ribosomal peptide synthetase  31.94 
 
 		 1368 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  30.67 
 
 		 1528 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  30.67 
 
 		 1520 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  33.46 
 
 		 3352 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  30.67 
 
 		 1483 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  31.63 
 
 		 3786 aa  182  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.39 
 
 		 4531 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  33.46 
 
 		 6072 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  29.42 
 
 		 2419 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  29.1 
 
 		 1487 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  33.46 
 
 		 6006 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32.42 
 
 		 5953 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  30.8 
 
 		 3291 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3427  enterobactin synthase subunit F  31.13 
 
 		 1325 aa  180  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168919  normal  0.066928 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0443  linear gramicidin synthetase subunit C  27.22 
 
 		 1193 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  29.77 
 
 		 3291 aa  180  7e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  27.77 
 
 		 541 aa  180  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2948  amino acid adenylation domain-containing protein  30.16 
 
 		 1057 aa  179  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.735724  normal  0.0141341 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4881  linear gramicidin synthetase subunit C  27.03 
 
 		 1193 aa  180  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2421  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  32.32 
 
 		 1044 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  32.81 
 
 		 1130 aa  179  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  31.08 
 
 		 2573 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  30.92 
 
 		 3348 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  30.32 
 
 		 5328 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0833  peptide synthetase  28.02 
 
 		 514 aa  179  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.53 
 
 		 2370 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0368  amino acid adenylation domain-containing protein  27.54 
 
 		 1194 aa  178  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  29.45 
 
 		 3498 aa  178  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6287  amino acid adenylation domain protein  32.25 
 
 		 1344 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  29.24 
 
 		 4960 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  33.14 
 
 		 3102 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  31.92 
 
 		 2155 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3845  amino acid adenylation domain-containing protein  30.97 
 
 		 1721 aa  177  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  32.93 
 
 		 4318 aa  177  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4121  amino acid adenylation domain protein  33.27 
 
 		 1583 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.183322  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0467  amino acid adenylation domain protein  30.73 
 
 		 2105 aa  176  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  29.24 
 
 		 4960 aa  176  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  29.46 
 
 		 2625 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  30.35 
 
 		 4572 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  28.68 
 
 		 1454 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  30.7 
 
 		 4106 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5529  non-ribosomal peptide synthetase  32.29 
 
 		 1356 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0099449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4452  non-ribosomal peptide synthetase  31.54 
 
 		 1395 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270452  normal  0.260871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20780  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  31.55 
 
 		 3539 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.040794 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3733  amino acid adenylation  29.67 
 
 		 2378 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>