More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3493 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3493  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1088    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0647541 
 
 
-
 
NC_003296  RS03108  hypothetical protein  34.17 
 
 		 551 aa  280  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2462  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 529 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0899  BarD  33.14 
 
 		 602 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2598  amino acid adenylation domain-containing protein  32.95 
 
 		 529 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0562  BarD  32.95 
 
 		 565 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276524  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3662  amino acid adenylation domain protein  33.47 
 
 		 543 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4215  amino acid adenylation domain protein  35.73 
 
 		 547 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  31.64 
 
 		 1078 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  28.46 
 
 		 541 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  32.43 
 
 		 3291 aa  220  5e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4662  amino acid adenylation  30.62 
 
 		 1346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  31.88 
 
 		 1413 aa  216  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  29.7 
 
 		 5738 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  31.96 
 
 		 3165 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0023  linear gramicidin synthetase subunit B  30.16 
 
 		 2681 aa  211  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1084  non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins-like protein  30.28 
 
 		 2638 aa  209  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  31.84 
 
 		 1138 aa  208  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  31.77 
 
 		 2201 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  28.46 
 
 		 2176 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  32.47 
 
 		 1336 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1102  non-ribosomal peptide synthetase  30.72 
 
 		 1345 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0166801  normal  0.534477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  31.77 
 
 		 5596 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  31.54 
 
 		 2867 aa  207  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  30.51 
 
 		 3335 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  31.14 
 
 		 13537 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.46 
 
 		 4968 aa  206  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  30.78 
 
 		 1363 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  31.25 
 
 		 8915 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  28.11 
 
 		 4196 aa  204  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  30.2 
 
 		 3498 aa  204  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  29.98 
 
 		 2033 aa  204  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  30.91 
 
 		 2187 aa  204  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  30.14 
 
 		 3018 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0174  amino acid adenylation  31.7 
 
 		 1332 aa  203  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2421  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  30.02 
 
 		 1044 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  28.66 
 
 		 1553 aa  203  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  31.27 
 
 		 2571 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  30.34 
 
 		 2626 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  29.62 
 
 		 5469 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  30.62 
 
 		 6676 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  29.42 
 
 		 1518 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  28.95 
 
 		 7168 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  30.86 
 
 		 4960 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  31.27 
 
 		 2571 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  30.16 
 
 		 3374 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.67 
 
 		 2370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  30.86 
 
 		 4960 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1177  amino acid adenylation  28.49 
 
 		 3137 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  29.94 
 
 		 6404 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  30.36 
 
 		 2791 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  30.91 
 
 		 5467 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5328  amino acid adenylation domain-containing protein  29.38 
 
 		 1351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.082468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  29.25 
 
 		 2419 aa  200  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  30.92 
 
 		 4520 aa  200  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  29.48 
 
 		 1518 aa  199  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  28.48 
 
 		 1069 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  32.06 
 
 		 9498 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0188  amino acid adenylation domain-containing protein  30.24 
 
 		 1638 aa  199  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  30.22 
 
 		 2581 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  29.74 
 
 		 2156 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  29.27 
 
 		 3291 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  28.43 
 
 		 2338 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20780  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  30.23 
 
 		 3539 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.040794 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7311  peptide synthetase  31.01 
 
 		 2183 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  30.23 
 
 		 2156 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  30.11 
 
 		 4747 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  29.27 
 
 		 3348 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  30.91 
 
 		 1110 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  29.57 
 
 		 6202 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  28.94 
 
 		 1528 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.85 
 
 		 8646 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  32.48 
 
 		 5372 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  29.11 
 
 		 4383 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  28.76 
 
 		 1137 aa  197  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  28.94 
 
 		 1518 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  28.43 
 
 		 2336 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  30.72 
 
 		 2883 aa  197  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  29.08 
 
 		 1483 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  29.08 
 
 		 1483 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  29.08 
 
 		 1528 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3052  amino acid adenylation domain-containing protein  30.75 
 
 		 524 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3477  amino acid adenylation domain-containing protein  29.69 
 
 		 1745 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0634623  normal  0.144372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0191  amino acid adenylation domain-containing protein  29.79 
 
 		 1071 aa  196  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4340  non-ribosomal peptide synthetase  28.46 
 
 		 1360 aa  196  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34953  normal  0.731167 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  29.08 
 
 		 1520 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2107  nonribosomal peptide synthetase, putative  30.78 
 
 		 1456 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.960336  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  29.08 
 
 		 2385 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.48 
 
 		 2385 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32.28 
 
 		 5953 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  30.48 
 
 		 5929 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.54 
 
 		 3432 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.68 
 
 		 2385 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  29.38 
 
 		 9175 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  30.02 
 
 		 5926 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  30.64 
 
 		 7712 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3972  non-ribosomal peptide synthetase  28.81 
 
 		 1368 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  30.77 
 
 		 2573 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  29.66 
 
 		 2386 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  30.12 
 
 		 1454 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>