More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4215 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4215  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 		 547 aa  1079    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03108  hypothetical protein  59.43 
 
 		 551 aa  589  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3662  amino acid adenylation domain protein  53.46 
 
 		 543 aa  549  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4213  AMP-dependent synthetase and ligase  53.06 
 
 		 551 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2462  amino acid adenylation domain-containing protein  37.55 
 
 		 529 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2598  amino acid adenylation domain-containing protein  37.35 
 
 		 529 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0899  BarD  37.55 
 
 		 602 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0562  BarD  37.26 
 
 		 565 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276524  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3493  hypothetical protein  35.73 
 
 		 523 aa  272  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0647541 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4340  non-ribosomal peptide synthetase  35.5 
 
 		 1360 aa  225  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34953  normal  0.731167 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5328  amino acid adenylation domain-containing protein  34.06 
 
 		 1351 aa  211  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.082468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  30.21 
 
 		 9175 aa  210  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  30.65 
 
 		 6202 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  31.59 
 
 		 5596 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3972  non-ribosomal peptide synthetase  34.77 
 
 		 1368 aa  208  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.564437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  29.43 
 
 		 1553 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5851  amino acid adenylation domain protein  34.19 
 
 		 1343 aa  207  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877772  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4452  non-ribosomal peptide synthetase  33.92 
 
 		 1395 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270452  normal  0.260871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3051  amino acid adenylation domain-containing protein  34.22 
 
 		 1457 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  33.46 
 
 		 13537 aa  203  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  34.54 
 
 		 5422 aa  203  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  34.22 
 
 		 5620 aa  203  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  34.21 
 
 		 4882 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0342  amino acid adenylation domain-containing protein  33.81 
 
 		 579 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  33.72 
 
 		 9498 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  35.8 
 
 		 2187 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  34 
 
 		 2258 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  28.95 
 
 		 2176 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  28.81 
 
 		 2033 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17200  non-ribosomal peptide synthase  31.37 
 
 		 504 aa  195  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.699646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0488  enterobactin synthase subunit F  31.77 
 
 		 1293 aa  195  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0606  enterobactin synthase subunit F  32.56 
 
 		 1293 aa  195  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.87 
 
 		 1806 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0636  enterobactin synthase subunit F  31.87 
 
 		 1293 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00553  enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP-dependent  31.87 
 
 		 1293 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3040  amino acid adenylation domain protein  31.87 
 
 		 1293 aa  194  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0606  enterobactin synthase subunit F  32.17 
 
 		 1293 aa  194  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  34.26 
 
 		 4383 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00542  hypothetical protein  31.87 
 
 		 1293 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0422505  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  33.46 
 
 		 4136 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  29.01 
 
 		 541 aa  193  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0671  enterobactin synthase subunit F  32.17 
 
 		 1293 aa  193  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1119  enterobactin synthase subunit F  32.47 
 
 		 1290 aa  192  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  35.03 
 
 		 1131 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  33.33 
 
 		 6676 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  30.05 
 
 		 1127 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  34.25 
 
 		 8646 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3058  enterobactin synthase subunit F  31.98 
 
 		 1293 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  30.14 
 
 		 5738 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20090  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  33 
 
 		 1344 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0150684  normal  0.025182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3427  enterobactin synthase subunit F  32.26 
 
 		 1325 aa  191  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168919  normal  0.066928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3845  amino acid adenylation domain-containing protein  32 
 
 		 1721 aa  191  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4746  amino acid adenylation  29.06 
 
 		 983 aa  190  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2564  enterobactin synthase subunit F  33.47 
 
 		 1304 aa  190  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.276813  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1677  amino acid adenylation domain protein  31.6 
 
 		 3289 aa  190  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  32.81 
 
 		 2201 aa  189  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  32.73 
 
 		 2573 aa  189  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  33.71 
 
 		 2155 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  32.48 
 
 		 3165 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  32.23 
 
 		 5213 aa  189  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  30.37 
 
 		 4968 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  31.23 
 
 		 3168 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3479  hypothetical protein  32.96 
 
 		 1279 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.165023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  30.63 
 
 		 893 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  30.45 
 
 		 1317 aa  189  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3477  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 1745 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0634623  normal  0.144372 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3487  amino acid adenylation domain-containing protein  32.95 
 
 		 521 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1002  non-ribosomal peptide synthetase  32.5 
 
 		 1358 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0203382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  33.4 
 
 		 2614 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  31.61 
 
 		 2628 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0555  amino acid adenylation domain protein  31.11 
 
 		 534 aa  187  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000001061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  35.28 
 
 		 7785 aa  187  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  34.39 
 
 		 2370 aa  187  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1102  non-ribosomal peptide synthetase  30.4 
 
 		 1345 aa  186  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0166801  normal  0.534477 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0995  amino acid adenylation domain-containing protein  29.42 
 
 		 1284 aa  186  8e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.966277  hitchhiker  0.000000137922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  31.79 
 
 		 6176 aa  186  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  33.33 
 
 		 1314 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.57 
 
 		 6889 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1866  amino acid adenylation  35.7 
 
 		 1074 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.996538  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3056  enterobactin synthase subunit F  30.98 
 
 		 1310 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07884  nonribosomal peptide synthase, putative (JCVI)  30.28 
 
 		 7214 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.729291  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10576  conserved hypothetical protein  29.7 
 
 		 1704 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.474495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2421  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  34.26 
 
 		 1044 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0174  amino acid adenylation  32.94 
 
 		 1332 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  30.32 
 
 		 3194 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  31.33 
 
 		 2596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  28.14 
 
 		 7168 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  32.7 
 
 		 2174 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  31.65 
 
 		 2878 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  30.36 
 
 		 1714 aa  184  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3891  amino acid adenylation domain protein  34.43 
 
 		 1256 aa  184  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  32.37 
 
 		 4531 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7311  peptide synthetase  31.65 
 
 		 2183 aa  183  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.62 
 
 		 1864 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  33.4 
 
 		 1152 aa  183  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2771  AMP-binding protein  24.86 
 
 		 597 aa  183  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  32.05 
 
 		 5926 aa  183  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0700  enterobactin synthase subunit F  32.1 
 
 		 1294 aa  183  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3466  amino acid adenylation  32.74 
 
 		 1745 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3529  amino acid adenylation domain-containing protein  32.74 
 
 		 1745 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>