More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2771 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2771  AMP-binding protein  100 
 
 
597 aa  1243    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431723  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2036  non-ribosomal peptide synthase amino acid adenylation subunit  32.17 
 
 
541 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2030  amino acid adenylation domain-containing protein  31.05 
 
 
550 aa  259  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 
539 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1182  enterobactin synthetase component F-related protein  31.9 
 
 
556 aa  239  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3052  amino acid adenylation domain-containing protein  34.73 
 
 
524 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0670  amino acid adenylation domain-containing protein  29.36 
 
 
517 aa  213  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2526  amino acid adenylation domain protein  28.55 
 
 
535 aa  200  6e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0452126 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  29.84 
 
 
1556 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  27.87 
 
 
4960 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  29.66 
 
 
1556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  27.52 
 
 
4960 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  28.85 
 
 
2439 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0687  amino acid adenylation domain-containing protein  29.57 
 
 
521 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3499  non-ribosomal peptide synthase amino acid adenylation subunit  29.17 
 
 
524 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2689  AMP-dependent synthetase and ligase  28.45 
 
 
507 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  29.52 
 
 
2156 aa  194  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1151  amino acid adenylation domain-containing protein  31.09 
 
 
496 aa  194  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2774  AMP-dependent synthetase and ligase  28.22 
 
 
514 aa  193  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149063  decreased coverage  0.000872135 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  27.04 
 
 
3695 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  29.7 
 
 
2156 aa  192  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  27.64 
 
 
4968 aa  192  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  28.27 
 
 
2054 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2570  amino acid adenylation domain-containing protein  28.03 
 
 
3114 aa  188  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0117255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  29.05 
 
 
2033 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  27.53 
 
 
1518 aa  187  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0131  amino acid adenylation domain-containing protein  28.27 
 
 
540 aa  187  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4746  amino acid adenylation  28.22 
 
 
983 aa  187  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  28.62 
 
 
2156 aa  187  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  28.04 
 
 
2385 aa  187  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  29.11 
 
 
1786 aa  187  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.04 
 
 
2385 aa  187  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.5 
 
 
2385 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.5 
 
 
2385 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  27.55 
 
 
2386 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  27.2 
 
 
2273 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  28.04 
 
 
1518 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0443  linear gramicidin synthetase subunit C  28.08 
 
 
1193 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  31.81 
 
 
2164 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  28.95 
 
 
3086 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  28.95 
 
 
3086 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1793  amino acid adenylation domain protein  26.1 
 
 
516 aa  185  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.787997  normal  0.406498 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4881  linear gramicidin synthetase subunit C  27.44 
 
 
1193 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  28.06 
 
 
2385 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  27.21 
 
 
1093 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  27.08 
 
 
1518 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.47 
 
 
2385 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0368  amino acid adenylation domain-containing protein  27.74 
 
 
1194 aa  184  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1676  amino acid adenylation domain protein  27.15 
 
 
1075 aa  183  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.501176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  28.47 
 
 
2193 aa  183  9.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3733  amino acid adenylation  27.1 
 
 
2378 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  28.02 
 
 
1363 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.67 
 
 
2385 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  26.63 
 
 
1833 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3984  amino acid adenylation  27.95 
 
 
1643 aa  181  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.585972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  25.99 
 
 
541 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  32.35 
 
 
1413 aa  180  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  28.3 
 
 
627 aa  180  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  28.22 
 
 
4572 aa  180  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  28.14 
 
 
3291 aa  180  7e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  27.65 
 
 
2386 aa  180  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.8 
 
 
2385 aa  179  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3051  amino acid adenylation domain-containing protein  26.96 
 
 
1457 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690626  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2723  amino acid adenylation domain protein  27.36 
 
 
591 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.85 
 
 
2385 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0555  amino acid adenylation domain protein  26.72 
 
 
534 aa  179  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000001061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21190  enterochelin sythetase component F (Serine-activating enzyme) (Seryl-AMP ligase)  27.97 
 
 
1330 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  28.38 
 
 
8914 aa  178  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  28.49 
 
 
3374 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4215  amino acid adenylation domain protein  28.23 
 
 
547 aa  177  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  29.01 
 
 
2664 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  29.01 
 
 
2395 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1664  amino acid adenylation domain protein  27.73 
 
 
998 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  29.01 
 
 
3824 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  29.01 
 
 
2395 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  27.72 
 
 
6404 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17200  non-ribosomal peptide synthase  25.37 
 
 
504 aa  176  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.699646  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  27.6 
 
 
2176 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1466  amino acid adenylation domain-containing protein  30.27 
 
 
494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  25.62 
 
 
4196 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  27.66 
 
 
4080 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1677  amino acid adenylation domain protein  27.11 
 
 
3289 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0425  amino acid adenylation domain-containing protein  27.15 
 
 
1405 aa  174  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.939372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  29.23 
 
 
1776 aa  174  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  31.47 
 
 
3395 aa  174  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3195  amino acid adenylation domain-containing protein  27.24 
 
 
2031 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0542  amino acid adenylation domain protein  26.63 
 
 
534 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.404103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  27.66 
 
 
4383 aa  173  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  26.9 
 
 
2151 aa  173  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  26.92 
 
 
5469 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  28.86 
 
 
888 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4340  non-ribosomal peptide synthetase  26 
 
 
1360 aa  173  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34953  normal  0.731167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6287  amino acid adenylation domain protein  26.29 
 
 
1344 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  29.45 
 
 
1569 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  27.85 
 
 
1142 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  28.79 
 
 
4502 aa  172  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1002  non-ribosomal peptide synthetase  31.37 
 
 
1358 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0203382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  28.54 
 
 
1498 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  27.99 
 
 
5422 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5851  amino acid adenylation domain protein  32.11 
 
 
1343 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>