More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2526 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0131  amino acid adenylation domain-containing protein  65.65 
 
 
540 aa  685    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2526  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
535 aa  1093    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0452126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2030  amino acid adenylation domain-containing protein  39.51 
 
 
550 aa  350  4e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2774  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 
514 aa  290  6e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149063  decreased coverage  0.000872135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2689  AMP-dependent synthetase and ligase  38.4 
 
 
507 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 
539 aa  272  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2036  non-ribosomal peptide synthase amino acid adenylation subunit  35.49 
 
 
541 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1151  amino acid adenylation domain-containing protein  36.36 
 
 
496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3052  amino acid adenylation domain-containing protein  35.4 
 
 
524 aa  249  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3499  non-ribosomal peptide synthase amino acid adenylation subunit  36.28 
 
 
524 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0670  amino acid adenylation domain-containing protein  34.69 
 
 
517 aa  240  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4746  amino acid adenylation  32.84 
 
 
983 aa  219  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  33.85 
 
 
7712 aa  219  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0687  amino acid adenylation domain-containing protein  34.54 
 
 
521 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3984  amino acid adenylation  33.33 
 
 
1643 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.585972 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  32.55 
 
 
2581 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  34.88 
 
 
4318 aa  215  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1182  enterobactin synthetase component F-related protein  30.19 
 
 
556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  33.4 
 
 
3374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  32.23 
 
 
4968 aa  213  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  31.64 
 
 
627 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  34.14 
 
 
4336 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  30.48 
 
 
1093 aa  209  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1749  amino acid adenylation domain protein  33.76 
 
 
1199 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.82306  normal  0.0351239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2771  AMP-binding protein  28.55 
 
 
597 aa  207  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  33.83 
 
 
1525 aa  207  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3092  amino acid adenylation domain protein  29.6 
 
 
1533 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3702  non ribosomal peptide synthase  33.21 
 
 
1134 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  32.04 
 
 
4960 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  32.89 
 
 
1801 aa  204  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6474  amino acid adenylation domain-containing protein  34.77 
 
 
1304 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.571102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  33.09 
 
 
4317 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  31.41 
 
 
1518 aa  204  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  31.49 
 
 
4960 aa  204  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  35.2 
 
 
8915 aa  203  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  32.96 
 
 
4317 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  29.89 
 
 
1556 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  35.2 
 
 
8914 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  30.09 
 
 
3695 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  30.91 
 
 
1518 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21190  enterochelin sythetase component F (Serine-activating enzyme) (Seryl-AMP ligase)  34.5 
 
 
1330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  31.59 
 
 
1518 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  31.98 
 
 
6176 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  30.08 
 
 
1556 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3029  amino acid adenylation domain protein  29.76 
 
 
1533 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1907  amino acid adenylation domain-containing protein  30.87 
 
 
625 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  34.08 
 
 
1314 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  30.45 
 
 
4196 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  33.4 
 
 
4336 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  33.15 
 
 
5469 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1866  amino acid adenylation  33.82 
 
 
1074 aa  200  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.996538  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2417  non-ribosomal peptide synthetase, putative  33.27 
 
 
1772 aa  200  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  33.15 
 
 
4317 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6287  amino acid adenylation domain protein  33 
 
 
1344 aa  199  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  33.65 
 
 
5467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  31.24 
 
 
1069 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.7 
 
 
6889 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  31.83 
 
 
5328 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  30.9 
 
 
2151 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3314  amino acid adenylation domain-containing protein  31.75 
 
 
923 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105674  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  29.42 
 
 
1550 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  33.46 
 
 
4332 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  29.3 
 
 
1078 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1677  amino acid adenylation domain protein  33.46 
 
 
3289 aa  198  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  33.97 
 
 
4342 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  32.85 
 
 
1776 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  32.63 
 
 
3761 aa  197  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  33.21 
 
 
2561 aa  197  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  33.86 
 
 
7785 aa  197  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3335  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  35.55 
 
 
1617 aa  197  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388415  normal  0.286594 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3195  amino acid adenylation domain-containing protein  28.12 
 
 
2031 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  31.46 
 
 
6202 aa  196  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  33.78 
 
 
4342 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  32.41 
 
 
7168 aa  196  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  33.82 
 
 
5230 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4073  amino acid adenylation domain protein  34.08 
 
 
1674 aa  196  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1404  non-ribosomal peptide synthetase  33.76 
 
 
1324 aa  196  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305242  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  33.4 
 
 
1483 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.32 
 
 
2385 aa  196  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  31.89 
 
 
2033 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  33.2 
 
 
3291 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0526  non-ribosomal peptide synthetase  33.33 
 
 
1675 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  32.04 
 
 
4317 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  35.16 
 
 
4747 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  34.2 
 
 
1130 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  33.4 
 
 
3348 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  33.4 
 
 
1483 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  31.12 
 
 
2385 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  32 
 
 
5654 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  33.79 
 
 
1769 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  32.61 
 
 
2626 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  33.4 
 
 
1528 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  33.4 
 
 
1520 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  31.09 
 
 
9175 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  32.3 
 
 
4502 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  30.05 
 
 
1569 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  31.86 
 
 
3331 aa  193  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1597  amino acid adenylation domain-containing protein  34.69 
 
 
1658 aa  194  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  33.4 
 
 
6661 aa  193  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.94 
 
 
2385 aa  193  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>