More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1182 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1182  enterobactin synthetase component F-related protein  100 
 
 		 556 aa  1158    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 		 539 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2030  amino acid adenylation domain-containing protein  33.27 
 
 		 550 aa  258  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2036  non-ribosomal peptide synthase amino acid adenylation subunit  32.71 
 
 		 541 aa  250  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2771  AMP-binding protein  31.9 
 
 		 597 aa  239  9e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431723  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0131  amino acid adenylation domain-containing protein  29.87 
 
 		 540 aa  216  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0670  amino acid adenylation domain-containing protein  30.59 
 
 		 517 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2689  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 		 507 aa  214  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2774  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 		 514 aa  213  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149063  decreased coverage  0.000872135 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2526  amino acid adenylation domain protein  30.74 
 
 		 535 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0452126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3052  amino acid adenylation domain-containing protein  32.64 
 
 		 524 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1151  amino acid adenylation domain-containing protein  31.7 
 
 		 496 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3499  non-ribosomal peptide synthase amino acid adenylation subunit  30.02 
 
 		 524 aa  197  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4746  amino acid adenylation  29.05 
 
 		 983 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3056  enterobactin synthase subunit F  30.13 
 
 		 1310 aa  179  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1119  enterobactin synthase subunit F  31.23 
 
 		 1290 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0687  amino acid adenylation domain-containing protein  31.77 
 
 		 521 aa  176  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3984  amino acid adenylation  30.08 
 
 		 1643 aa  173  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.585972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  28.12 
 
 		 4342 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  29.91 
 
 		 4342 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  30.21 
 
 		 4317 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1530  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.21 
 
 		 504 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  30.02 
 
 		 4317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1487  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.21 
 
 		 504 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  28.02 
 
 		 1363 aa  168  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1424  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.21 
 
 		 504 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1287  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.21 
 
 		 503 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1259  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.21 
 
 		 504 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1261  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.21 
 
 		 504 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1461  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.21 
 
 		 504 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  32.23 
 
 		 4317 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3920  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.21 
 
 		 504 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1389  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  30.21 
 
 		 503 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  29.67 
 
 		 5230 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3058  enterobactin synthase subunit F  30.93 
 
 		 1293 aa  166  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0671  enterobactin synthase subunit F  30.6 
 
 		 1293 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1294  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  29.11 
 
 		 504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.711083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  27.24 
 
 		 1317 aa  166  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  26.61 
 
 		 3695 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0165  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  31.3 
 
 		 506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000579194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0606  enterobactin synthase subunit F  30.93 
 
 		 1293 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630178  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00553  enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP-dependent  30.26 
 
 		 1293 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3040  amino acid adenylation domain protein  30.26 
 
 		 1293 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0700  enterobactin synthase subunit F  30.24 
 
 		 1294 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00542  hypothetical protein  30.26 
 
 		 1293 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0422505  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0636  enterobactin synthase subunit F  30.26 
 
 		 1293 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0606  enterobactin synthase subunit F  30.07 
 
 		 1293 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  27.98 
 
 		 2054 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2564  enterobactin synthase subunit F  27.75 
 
 		 1304 aa  164  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.276813  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1092  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  28.84 
 
 		 504 aa  164  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0746  enterobactin synthase subunit F  30.24 
 
 		 1294 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0684  enterobactin synthase subunit F  30.24 
 
 		 1294 aa  163  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.885796 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0627  enterobactin synthase subunit F  29.95 
 
 		 1294 aa  163  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  27.24 
 
 		 1336 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1439 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0641  enterobactin synthase subunit F  30.13 
 
 		 1294 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1675  CtaG  32.7 
 
 		 1353 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1593  non-ribosomal peptide synthase  32.7 
 
 		 1346 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0187  syringopeptin synthetase C  32.7 
 
 		 1345 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1664  amino acid adenylation domain protein  26.19 
 
 		 998 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0488  enterobactin synthase subunit F  30.51 
 
 		 1293 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1817  D-alanine-activating enzyme  26.87 
 
 		 509 aa  160  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  29.6 
 
 		 1130 aa  161  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3874  amino acid adenylation domain protein  28.19 
 
 		 1665 aa  160  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0218124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0425  amino acid adenylation domain-containing protein  27.13 
 
 		 1405 aa  160  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.939372 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2598  amino acid adenylation domain-containing protein  26.67 
 
 		 529 aa  160  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09690  Non-ribosomal peptide synthetase, with condensation, AMP binding and thioesterase modules  30.91 
 
 		 1388 aa  159  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  27.39 
 
 		 1520 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  27.39 
 
 		 1483 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  27.55 
 
 		 3293 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  27.39 
 
 		 1483 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  27.39 
 
 		 3291 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0576  amino acid adenylation domain protein  33.7 
 
 		 503 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  29.04 
 
 		 4332 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  28.25 
 
 		 3875 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  27.39 
 
 		 1528 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02545  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  27.99 
 
 		 6919 aa  159  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6287  amino acid adenylation domain protein  26.34 
 
 		 1344 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2462  amino acid adenylation domain-containing protein  26.67 
 
 		 529 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3427  enterobactin synthase subunit F  29.44 
 
 		 1325 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168919  normal  0.066928 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03496  putative nonribosomal peptide synthetase (Eurofung)  27.06 
 
 		 2326 aa  157  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.768787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  31.37 
 
 		 1042 aa  158  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  25.83 
 
 		 541 aa  158  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0899  BarD  26.61 
 
 		 602 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0562  BarD  26.96 
 
 		 565 aa  158  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276524  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  27.61 
 
 		 2006 aa  157  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.7 
 
 		 7541 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  32.87 
 
 		 1321 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  29.87 
 
 		 5328 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  29.95 
 
 		 5372 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  34.31 
 
 		 4520 aa  157  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  29.53 
 
 		 4572 aa  157  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3733  amino acid adenylation  26.58 
 
 		 2378 aa  156  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1910  hypothetical protein  27.04 
 
 		 521 aa  156  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  27.67 
 
 		 2752 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1102  non-ribosomal peptide synthetase  33.42 
 
 		 1345 aa  156  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0166801  normal  0.534477 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10576  conserved hypothetical protein  31.75 
 
 		 1704 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.474495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  28.71 
 
 		 1158 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  28.32 
 
 		 1779 aa  155  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4216  amino acid adenylation domain-containing protein  29.15 
 
 		 568 aa  155  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>