More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2689 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2774  AMP-dependent synthetase and ligase  66.54 
 
 		 514 aa  640    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149063  decreased coverage  0.000872135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2689  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 507 aa  1010    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3499  non-ribosomal peptide synthase amino acid adenylation subunit  44.19 
 
 		 524 aa  336  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2030  amino acid adenylation domain-containing protein  39.16 
 
 		 550 aa  334  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3052  amino acid adenylation domain-containing protein  43.12 
 
 		 524 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0670  amino acid adenylation domain-containing protein  42.06 
 
 		 517 aa  301  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0687  amino acid adenylation domain-containing protein  37.3 
 
 		 521 aa  280  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2526  amino acid adenylation domain protein  37.98 
 
 		 535 aa  276  9e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0452126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1151  amino acid adenylation domain-containing protein  41.72 
 
 		 496 aa  263  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0131  amino acid adenylation domain-containing protein  37.67 
 
 		 540 aa  259  7e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 539 aa  234  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  36.31 
 
 		 5953 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2036  non-ribosomal peptide synthase amino acid adenylation subunit  32.84 
 
 		 541 aa  216  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1182  enterobactin synthetase component F-related protein  29.74 
 
 		 556 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3577  amino acid adenylation domain protein  35.8 
 
 		 2412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.92 
 
 		 6889 aa  211  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6474  amino acid adenylation domain-containing protein  34.12 
 
 		 1304 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.571102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  34.95 
 
 		 5929 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  32.94 
 
 		 6676 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  34.75 
 
 		 5328 aa  204  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  33.85 
 
 		 5372 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  34.56 
 
 		 5469 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  33.92 
 
 		 4101 aa  203  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  34.97 
 
 		 1779 aa  203  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  32.88 
 
 		 4383 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.3 
 
 		 8646 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  34.44 
 
 		 13537 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 		 1776 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  36.43 
 
 		 2651 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  32.55 
 
 		 1483 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  32.55 
 
 		 1483 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  32.55 
 
 		 1528 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  32.55 
 
 		 1520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  32.75 
 
 		 6006 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  32.87 
 
 		 5422 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  29.61 
 
 		 2156 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  29.43 
 
 		 2156 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  28.57 
 
 		 3695 aa  200  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  32.67 
 
 		 4882 aa  200  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  32.49 
 
 		 2666 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0188  amino acid adenylation domain-containing protein  35.83 
 
 		 1638 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  32.36 
 
 		 3291 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  34.56 
 
 		 1130 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  35.82 
 
 		 5698 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  33.78 
 
 		 5926 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  32.51 
 
 		 1405 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  32.42 
 
 		 4968 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20090  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  32.69 
 
 		 1344 aa  197  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0150684  normal  0.025182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  33.2 
 
 		 7122 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  34.03 
 
 		 6176 aa  197  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  32.36 
 
 		 3348 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  32.75 
 
 		 1383 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  30.6 
 
 		 1753 aa  196  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  33.78 
 
 		 2448 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  31.69 
 
 		 2154 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  31.13 
 
 		 2033 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  32.07 
 
 		 5230 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2771  AMP-binding protein  28.45 
 
 		 597 aa  195  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431723  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  29.61 
 
 		 2156 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  30.14 
 
 		 1336 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  30.43 
 
 		 2338 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  30.43 
 
 		 2336 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  31.97 
 
 		 4531 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  30.22 
 
 		 2345 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4746  amino acid adenylation  28.33 
 
 		 983 aa  193  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  31.04 
 
 		 1518 aa  192  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  32.2 
 
 		 9498 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  31.4 
 
 		 2625 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  33.4 
 
 		 2626 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  34.64 
 
 		 3208 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1664  amino acid adenylation domain protein  27.39 
 
 		 998 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0465  amino acid adenylation domain protein  32.09 
 
 		 1047 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.774823  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  31.67 
 
 		 3942 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  34.04 
 
 		 6403 aa  191  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  32.75 
 
 		 2896 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  30.23 
 
 		 2199 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  34.71 
 
 		 2258 aa  190  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  33.33 
 
 		 1801 aa  190  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  30.8 
 
 		 2151 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  30.49 
 
 		 3308 aa  190  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 1449 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  34.43 
 
 		 2137 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  31.38 
 
 		 4960 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  32.45 
 
 		 3470 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0642  amino acid adenylation domain protein  34.41 
 
 		 1282 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  31.79 
 
 		 3432 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  31.28 
 
 		 2273 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  30.95 
 
 		 9175 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  30.78 
 
 		 1518 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  30.92 
 
 		 4502 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.42 
 
 		 1839 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  33.99 
 
 		 1769 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  28.38 
 
 		 888 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  29.53 
 
 		 6202 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  32.29 
 
 		 5596 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  30.65 
 
 		 1518 aa  187  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  32.71 
 
 		 6072 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  32.95 
 
 		 1167 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  33.8 
 
 		 1131 aa  186  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  32.75 
 
 		 1113 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>