More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0687 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0687  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 		 521 aa  1057    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3499  non-ribosomal peptide synthase amino acid adenylation subunit  50.49 
 
 		 524 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0670  amino acid adenylation domain-containing protein  45.93 
 
 		 517 aa  428  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3052  amino acid adenylation domain-containing protein  46.73 
 
 		 524 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1151  amino acid adenylation domain-containing protein  43.52 
 
 		 496 aa  363  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2030  amino acid adenylation domain-containing protein  36.5 
 
 		 550 aa  296  7e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2774  AMP-dependent synthetase and ligase  37.89 
 
 		 514 aa  293  7e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149063  decreased coverage  0.000872135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2689  AMP-dependent synthetase and ligase  37.3 
 
 		 507 aa  280  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2036  non-ribosomal peptide synthase amino acid adenylation subunit  35.01 
 
 		 541 aa  259  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4746  amino acid adenylation  32.22 
 
 		 983 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  35.32 
 
 		 2651 aa  210  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2526  amino acid adenylation domain protein  34.54 
 
 		 535 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0452126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6287  amino acid adenylation domain protein  34.1 
 
 		 1344 aa  203  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3984  amino acid adenylation  29.71 
 
 		 1643 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.585972 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0131  amino acid adenylation domain-containing protein  32.48 
 
 		 540 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  30.4 
 
 		 2176 aa  201  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  32.83 
 
 		 2273 aa  200  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  30.34 
 
 		 1550 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2771  AMP-binding protein  29.57 
 
 		 597 aa  197  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431723  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  33.27 
 
 		 2626 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  32.64 
 
 		 2201 aa  196  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  36.84 
 
 		 8211 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 		 539 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3195  amino acid adenylation domain-containing protein  29.11 
 
 		 2031 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  33.59 
 
 		 5422 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  32.14 
 
 		 4383 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  29.14 
 
 		 2791 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3092  amino acid adenylation domain protein  30.39 
 
 		 1533 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  29.76 
 
 		 3086 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  29.5 
 
 		 1556 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  29.76 
 
 		 3086 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  31.3 
 
 		 1518 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  31.64 
 
 		 6176 aa  190  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  29.69 
 
 		 1336 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  33.59 
 
 		 2155 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  33.33 
 
 		 4882 aa  188  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  31.21 
 
 		 2666 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  31.3 
 
 		 1518 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  31.05 
 
 		 2508 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  29.68 
 
 		 2571 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2429  amino acid adenylation domain protein  35.02 
 
 		 1766 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3493  hypothetical protein  29.13 
 
 		 523 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0647541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  31.08 
 
 		 4101 aa  185  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  31.35 
 
 		 5328 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  29.68 
 
 		 2571 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  31.78 
 
 		 1776 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  31.58 
 
 		 3942 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  32.43 
 
 		 2625 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5753  amino acid adenylation domain protein  29.09 
 
 		 1525 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  28.76 
 
 		 1556 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3029  amino acid adenylation domain protein  30.39 
 
 		 1533 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  31.3 
 
 		 5596 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.2 
 
 		 8646 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0542  amino acid adenylation domain protein  28.84 
 
 		 534 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.404103  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  30.57 
 
 		 6202 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20090  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  31.25 
 
 		 1344 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0150684  normal  0.025182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  31.29 
 
 		 3002 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  30.99 
 
 		 4968 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  31.26 
 
 		 2419 aa  180  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0368  amino acid adenylation domain-containing protein  28.19 
 
 		 1194 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  31.81 
 
 		 2151 aa  180  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.76 
 
 		 6889 aa  179  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1967  amino acid adenylation domain-containing protein  32.65 
 
 		 1087 aa  179  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  34.17 
 
 		 3208 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  30.53 
 
 		 1518 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3577  amino acid adenylation domain protein  34.31 
 
 		 2412 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  30.87 
 
 		 4336 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  31.59 
 
 		 2596 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2424  non-ribosomal peptide synthetase  31.83 
 
 		 1178 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  32.16 
 
 		 5654 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  28.76 
 
 		 3374 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2579  amino acid adenylation domain-containing protein  31.05 
 
 		 649 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.947565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  28.04 
 
 		 541 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  31.51 
 
 		 3331 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0465  amino acid adenylation domain protein  30.93 
 
 		 1047 aa  177  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.774823  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  31.17 
 
 		 2154 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  31.37 
 
 		 1528 aa  177  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  33.27 
 
 		 2448 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0555  amino acid adenylation domain protein  29.21 
 
 		 534 aa  176  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000001061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  32.29 
 
 		 2883 aa  176  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1182  enterobactin synthetase component F-related protein  31.77 
 
 		 556 aa  176  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0518  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  27.79 
 
 		 485 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1717  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  28.31 
 
 		 2295 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  31.95 
 
 		 3432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  31.47 
 
 		 4502 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  31.05 
 
 		 1104 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  30.1 
 
 		 1801 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  31.43 
 
 		 3291 aa  174  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  31.32 
 
 		 4318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  32.42 
 
 		 1779 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  31.47 
 
 		 4106 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  31.39 
 
 		 6403 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  31.03 
 
 		 3470 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  27.54 
 
 		 1142 aa  173  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3185  amino acid adenylation domain protein  31.63 
 
 		 1668 aa  173  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0410873  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  35.08 
 
 		 2350 aa  173  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4709  coronamic acid synthetase CmaA  31.05 
 
 		 595 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.272779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  33.2 
 
 		 7712 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.27 
 
 		 1839 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  29.85 
 
 		 2151 aa  172  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>