More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4709 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4709  coronamic acid synthetase CmaA  100 
 
 		 595 aa  1227    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.272779  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  32.56 
 
 		 1069 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  32.75 
 
 		 627 aa  272  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  30.56 
 
 		 1449 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  31.37 
 
 		 1093 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  32.78 
 
 		 3710 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  30.43 
 
 		 2561 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  32.57 
 
 		 3335 aa  249  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5582  putative nonribosomal peptide synthetase (NPRS)  31.72 
 
 		 1654 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  31.26 
 
 		 1078 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1794  amino acid adenylation  34.67 
 
 		 3064 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.206481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  32.39 
 
 		 6676 aa  246  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2579  amino acid adenylation domain-containing protein  32.86 
 
 		 649 aa  244  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.947565  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  33.04 
 
 		 5929 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  34.53 
 
 		 3165 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03120  putative peptide synthetase protein  33.45 
 
 		 1418 aa  242  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  31.66 
 
 		 1142 aa  241  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4309  amino acid adenylation domain protein  32.75 
 
 		 2577 aa  241  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.5 
 
 		 2370 aa  241  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1746  amino acid adenylation domain protein  30.72 
 
 		 3223 aa  239  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3090  amino acid adenylation domain protein  32.46 
 
 		 1466 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  30.99 
 
 		 7168 aa  239  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  32.7 
 
 		 3639 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1704  amino acid adenylation  32.44 
 
 		 1322 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.410435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3762  amino acid adenylation domain protein  30.77 
 
 		 637 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  32.67 
 
 		 3247 aa  238  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.31 
 
 		 8646 aa  237  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  31.41 
 
 		 1689 aa  236  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3031  amino acid adenylation domain protein  32.22 
 
 		 1466 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1226  peptide synthetase, putative  32.52 
 
 		 548 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  33.58 
 
 		 1726 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  31.39 
 
 		 5596 aa  234  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  31.65 
 
 		 1454 aa  233  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  31.85 
 
 		 3018 aa  232  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  32.66 
 
 		 2605 aa  232  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1439 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6051  amino acid adenylation domain-containing protein  35.71 
 
 		 500 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0828298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3487  amino acid adenylation domain-containing protein  32.46 
 
 		 521 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6556  siderophore 2,3-dihydroxybenzoate (DHB) synthesis protein  32.38 
 
 		 1305 aa  230  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416947  hitchhiker  0.00000457979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4895  amino acid adenylation domain-containing protein  34.13 
 
 		 1035 aa  229  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1973  MCP methyltransferase, CheR-type  34.91 
 
 		 1137 aa  228  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  32.32 
 
 		 2596 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  30.96 
 
 		 1315 aa  227  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6968  non-ribosomal peptide synthetase  31.34 
 
 		 599 aa  227  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4035  amino acid adenylation domain-containing protein  32.46 
 
 		 521 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  30.69 
 
 		 5738 aa  226  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1971  amino acid adenylation domain-containing protein  32.16 
 
 		 1109 aa  225  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.353817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  31.99 
 
 		 2137 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  31.1 
 
 		 6006 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  32.79 
 
 		 13537 aa  223  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  31.1 
 
 		 6072 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  30.92 
 
 		 3352 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  30.92 
 
 		 3328 aa  223  8e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  32.98 
 
 		 5926 aa  223  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  30.84 
 
 		 7122 aa  223  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  31.79 
 
 		 1769 aa  223  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.85 
 
 		 6889 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  30.92 
 
 		 6081 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  32.97 
 
 		 3168 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  32.04 
 
 		 4960 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.53 
 
 		 2385 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  30.53 
 
 		 1870 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.7 
 
 		 2385 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.48 
 
 		 2385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  29.98 
 
 		 2386 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2267  amino acid adenylation  31.44 
 
 		 3031 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.962511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  30.49 
 
 		 4531 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  32.01 
 
 		 3629 aa  221  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.71 
 
 		 1336 aa  221  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20780  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  31.13 
 
 		 3539 aa  220  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.040794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2611  amino acid adenylation  30.93 
 
 		 614 aa  220  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1248  amino acid adenylation domain protein  30.59 
 
 		 653 aa  220  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  31.62 
 
 		 4882 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  31.33 
 
 		 1789 aa  219  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  30.47 
 
 		 3086 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  33.1 
 
 		 5953 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5821  amino acid adenylation domain-containing protein  35.28 
 
 		 506 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6287  amino acid adenylation domain protein  32.26 
 
 		 1344 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0855  amino acid adenylation domain protein  29.37 
 
 		 1375 aa  219  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2948  amino acid adenylation domain-containing protein  32.12 
 
 		 1057 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.735724  normal  0.0141341 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  30.12 
 
 		 3761 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1677  amino acid adenylation domain protein  29.36 
 
 		 3289 aa  219  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4495  amino acid adenylation domain protein  31.97 
 
 		 559 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  32.21 
 
 		 5372 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  31.78 
 
 		 2571 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2121  linear gramicidin synthetase subunit C  33.94 
 
 		 528 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.847277  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  30.93 
 
 		 3086 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  31.78 
 
 		 2571 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  30.74 
 
 		 5469 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  30.8 
 
 		 6661 aa  218  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  28.88 
 
 		 2164 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  31.14 
 
 		 1779 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  31.08 
 
 		 2273 aa  217  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  28.67 
 
 		 1336 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  30.57 
 
 		 8211 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  31.34 
 
 		 4960 aa  217  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  28.69 
 
 		 2791 aa  217  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1659  linear gramicidin synthetase subunit C  31.73 
 
 		 505 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1715  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  30.16 
 
 		 2543 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  31.87 
 
 		 5750 aa  217  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>