More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0444 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0444  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  100 
 
 
99 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1900  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  61.96 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0610024 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0077  HPr family phosphocarrier protein  55.68 
 
 
91 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.984139 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4626  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  61.9 
 
 
92 aa  97.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563542  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0371  phosphotransferase system, HPr  50.57 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0255941 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0357  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.28 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3446  HPrNtr  56.98 
 
 
112 aa  92.8  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0467  HPrNtr  46.59 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.319274  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0397  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.68 
 
 
90 aa  90.9  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.081426  normal  0.0975704 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0261  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.33 
 
 
89 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0442  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.33 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293204  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0222  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.84 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064621 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3315  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.72 
 
 
91 aa  87.8  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.297486  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1406  phosphocarrier protein HPr  51.16 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3965  phosphocarrier protein NPR  50.57 
 
 
91 aa  87.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3212  phosphocarrier protein HPr  51.16 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0492  phosphocarrier protein HPr  51.16 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0657  phosphocarrier protein HPr  51.16 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0712  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.28 
 
 
91 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0372719  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3353  HPr family phosphocarrier protein  50.57 
 
 
91 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.056229  normal  0.054295 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2833  phosphocarrier protein HPr  51.16 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858125  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0668  HPr family phosphocarrier protein  50.57 
 
 
91 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0597918  normal  0.15009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3672  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.28 
 
 
91 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0025895  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0682  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.28 
 
 
91 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.520502  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0473  phosphocarrier protein HPr  51.16 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0186  phosphocarrier protein HPr  51.16 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.43 
 
 
88 aa  87.4  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2778  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 
89 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2872  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 
89 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2247  phosphotransferase system, HPr  50 
 
 
89 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0669  HPr family phosphocarrier protein  49.43 
 
 
91 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0255747  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0530  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.16 
 
 
89 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0602783  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2861  HPr family phosphocarrier protein  50 
 
 
89 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0203  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.67 
 
 
89 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.268008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4185  HPrNtr  51.16 
 
 
89 aa  86.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0711  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.28 
 
 
91 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0703  phosphocarrier, HPr family  47.13 
 
 
91 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.45808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6190  HPrNtr  50 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0245  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0347  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase  48.84 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.01 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0296  phosphoryl transfer system, HPr  50 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2916  HPr family phosphocarrier protein  48.84 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0593  HPrNtr  47.31 
 
 
112 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.040328  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0439  HPrNtr  52.33 
 
 
113 aa  84.3  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3092  phosphocarrier protein NPR  50 
 
 
91 aa  84.3  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429943  normal  0.129077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7372  PTS system phosphocarrier protein HPr  48.86 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0412  phosphocarrier protein HPr  48.84 
 
 
89 aa  84  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889761  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2113  phosphocarrier protein NPr  50.56 
 
 
92 aa  83.6  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3621  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.19 
 
 
91 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1930  phosphocarrier protein HPr  51.19 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000294443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0572  HPr family phosphocarrier protein  47.73 
 
 
92 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0722  phosphocarrier protein NPR  49.43 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.118934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4244  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.43 
 
 
91 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  hitchhiker  0.000000216421 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4547  phosphocarrier protein NPr  47.67 
 
 
91 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  48.81 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3248  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.94 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3381  phosphocarrier, HPr family protein  46.59 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.497363  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0344  phosphoryl transfer system, HPr  47.25 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155438 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2849  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.78 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531241  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2234  HPr family phosphocarrier protein  50.59 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0720  phosphoryl transfer system, HPr  46.51 
 
 
89 aa  80.1  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4897  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.67 
 
 
89 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2436  phosphotransferase system, HPr  51.16 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.119206  normal  0.979343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2420  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.71 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.11815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3385  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.38 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1234  HPr family phosphocarrier protein  48.28 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0251  phosphocarrier, HPr family  47.42 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1396  phosphocarrier, HPr family  48.28 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.135473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1031  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.4 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.78 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2387  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.75 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357738  hitchhiker  0.00387358 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2132  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.28 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595795  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0744  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.43 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0152  HPrNtr  42.86 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28673  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3575  HPr family phosphocarrier protein  47.67 
 
 
101 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0170  phosphocarrier, HPr family  42.86 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1288  HPrNtr  46.51 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12196  hitchhiker  0.00000200864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0157  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.68 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0159  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.86 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2966  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.88 
 
 
88 aa  77  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.351605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1882  phosphocarrier protein HPr  44.19 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2095  phosphocarrier protein HPr  46.51 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2014  phosphocarrier protein HPr  46.51 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.205162  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0291  phosphocarrier, HPr family  44.19 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1952  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.34 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0874  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.15 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20160  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.02 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2052  HPrNtr  48.31 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.67872  normal  0.126322 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0494  phosphocarrier protein NPr  45.12 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03197  phosphocarrier protein NPR  41.38 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.789521  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0130  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.02 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0517698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3182  HNH nuclease  47.5 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2848  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.67 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0296  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.02 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166635 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0485  phosphotransferase system, HPr  43.68 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.467636  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0824  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.35 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0540  hypothetical protein  43.9 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0516  hypothetical protein  43.9 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2799  phosphoryl transfer system, HPr  48.19 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>