More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0245 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0245  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  179  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0296  phosphoryl transfer system, HPr  94.38 
 
 		 89 aa  170  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0203  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  84.27 
 
 		 89 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.268008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0347  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase  84.27 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0442  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  80.9 
 
 		 89 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0222  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  83.15 
 
 		 89 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000064621 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2778  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  79.78 
 
 		 89 aa  151  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2872  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  79.78 
 
 		 89 aa  151  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2247  phosphotransferase system, HPr  79.78 
 
 		 89 aa  151  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2861  HPr family phosphocarrier protein  79.78 
 
 		 89 aa  151  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0412  phosphocarrier protein HPr  79.78 
 
 		 89 aa  150  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889761  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6190  HPrNtr  79.78 
 
 		 89 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2916  HPr family phosphocarrier protein  78.65 
 
 		 89 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3212  phosphocarrier protein HPr  78.65 
 
 		 89 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0657  phosphocarrier protein HPr  78.65 
 
 		 89 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0492  phosphocarrier protein HPr  78.65 
 
 		 89 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1406  phosphocarrier protein HPr  78.65 
 
 		 89 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2833  phosphocarrier protein HPr  78.65 
 
 		 89 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0473  phosphocarrier protein HPr  78.65 
 
 		 89 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0186  phosphocarrier protein HPr  78.65 
 
 		 89 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0530  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  76.4 
 
 		 89 aa  144  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0602783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4185  HPrNtr  76.4 
 
 		 89 aa  144  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0261  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  76.4 
 
 		 89 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0238  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  74.16 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  0.320844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0353  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  74.16 
 
 		 89 aa  131  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000307134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4083  phosphoryl transfer system, HPr  71.91 
 
 		 89 aa  130  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0298  HPrNtr  70.79 
 
 		 89 aa  126  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4897  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  66.29 
 
 		 89 aa  126  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0291  phosphocarrier, HPr family  69.66 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0408  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  68.54 
 
 		 89 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0296  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  68.54 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166635 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1657  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  71.76 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.769211 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  67.82 
 
 		 89 aa  120  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1031  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  68.54 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1952  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  70.59 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0147  HPrNtr  62.92 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0324  phosphocarrier protein HPr  65.17 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273003  normal  0.0186594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1281  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  66.29 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0468  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  64.04 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.278707  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0219  HPrNtr  62.92 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  59.77 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2719  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  61.8 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0467  HPrNtr  54.55 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.319274  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3182  HNH nuclease  56.18 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0371  phosphotransferase system, HPr  53.41 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255941 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0720  phosphoryl transfer system, HPr  53.93 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4626  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.02 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2799  phosphoryl transfer system, HPr  55.06 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0357  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.27 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0602  HPrNtr  67.42 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0540  hypothetical protein  52.81 
 
 		 89 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0516  hypothetical protein  52.81 
 
 		 89 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0744  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  60.98 
 
 		 89 aa  99.4  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0751  phosphotransferase system HPr enzyme  55.17 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1882  phosphocarrier protein HPr  55.17 
 
 		 88 aa  98.2  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0665  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.02 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4151  phosphocarrier HPr protein  55.56 
 
 		 90 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4267  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.67 
 
 		 90 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57980  putative phosphoryl carrier protein  56.98 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0130  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.14 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0517698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3385  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.17 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0948  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.67 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02220  phosphotransferase system HPr enzyme  52.87 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340612  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0955  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.67 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0593  HPrNtr  55 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.040328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0987  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.67 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0948  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.72 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4457  phosphocarrier protein HPr  54.44 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.576235  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5039  phosphocarrier protein HPr  55.81 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.37142  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2420  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50.56 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.11815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1288  HPrNtr  55.17 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12196  hitchhiker  0.00000200864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2966  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.87 
 
 		 88 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.351605  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.28 
 
 		 88 aa  93.6  9e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0874  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.02 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2161  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.72 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0866  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.22 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176719  normal  0.959659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0853  HPrNtr  55.56 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3575  HPr family phosphocarrier protein  49.43 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0756  phosphocarrier protein HPr  49.43 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1209  phosphocarrier protein HPr  49.43 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2760  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.5 
 
 		 93 aa  90.1  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1930  phosphocarrier protein HPr  52.87 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000294443  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12750  Phosphocarrier NPr protein  52.33 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0439  HPrNtr  48.86 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0048  phosphocarrier protein HPr  48.84 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2234  HPr family phosphocarrier protein  51.85 
 
 		 119 aa  88.2  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3092  phosphocarrier protein NPR  47.67 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429943  normal  0.129077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3446  HPrNtr  48.84 
 
 		 112 aa  87  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0444  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2737  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.73 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0535175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5437  phosphocarrier, HPr family  47.73 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3315  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.98 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.297486  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0682  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.68 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.520502  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2095  phosphocarrier protein HPr  47.67 
 
 		 104 aa  85.5  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0152  HPrNtr  47.06 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28673  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2387  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.59 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357738  hitchhiker  0.00387358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0251  phosphocarrier, HPr family  46.59 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0712  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.68 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0372719  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3672  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.68 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0025895  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2014  phosphocarrier protein HPr  47.67 
 
 		 104 aa  85.5  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.205162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>