More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0048 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0048  phosphocarrier protein HPr  100 
 
 		 91 aa  184  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3248  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  75.28 
 
 		 97 aa  142  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0824  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  69.66 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2095  phosphocarrier protein HPr  67.42 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2014  phosphocarrier protein HPr  67.42 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.205162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3575  HPr family phosphocarrier protein  65.91 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4292  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  69.23 
 
 		 91 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2849  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  63.64 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531241  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7372  PTS system phosphocarrier protein HPr  64.77 
 
 		 109 aa  114  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3965  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  68.13 
 
 		 91 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0357  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  62.07 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0371  phosphotransferase system, HPr  62.07 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0467  HPrNtr  59.77 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.319274  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0593  HPrNtr  63.1 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.040328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0541  HPrNtr  60.23 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2737  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.55 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0535175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1234  HPr family phosphocarrier protein  58.62 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1396  phosphocarrier, HPr family  58.62 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.135473 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3446  HPrNtr  57.95 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0439  HPrNtr  61.63 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0319  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  59.3 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.734437  normal  0.80364 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2848  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  57.3 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2560  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  60.47 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0115  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  66.67 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.158465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4626  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  58.14 
 
 		 92 aa  100  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0397  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.67 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.081426  normal  0.0975704 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2436  phosphotransferase system, HPr  59.52 
 
 		 89 aa  97.1  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.119206  normal  0.979343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2387  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.12 
 
 		 105 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357738  hitchhiker  0.00387358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5437  phosphocarrier, HPr family  52.94 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0077  HPr family phosphocarrier protein  51.11 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.984139 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50.59 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0229  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.76 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0207173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1930  phosphocarrier protein HPr  55 
 
 		 95 aa  90.5  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000294443  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0207  phosphotransferase system  52.38 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0344  phosphoryl transfer system, HPr  60.71 
 
 		 109 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1686  putative phosphocarrier HPr protein  59.3 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.842664  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0251  phosphocarrier, HPr family  47.73 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0245  hypothetical protein  48.84 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1175  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  59.77 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  50.59 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0442  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.75 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0203  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.67 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.268008 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0222  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.67 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000064621 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1882  phosphocarrier protein HPr  45.98 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0468  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.81 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.278707  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0347  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase  47.67 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0261  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.25 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1952  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.4 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0473  phosphocarrier protein HPr  52.5 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3212  phosphocarrier protein HPr  52.5 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0296  phosphoryl transfer system, HPr  48.84 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0657  phosphocarrier protein HPr  52.5 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6190  HPrNtr  51.25 
 
 		 89 aa  85.5  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2833  phosphocarrier protein HPr  52.5 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0492  phosphocarrier protein HPr  52.5 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0186  phosphocarrier protein HPr  52.5 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1406  phosphocarrier protein HPr  52.5 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2799  phosphoryl transfer system, HPr  48.81 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.19 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2872  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.25 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2247  phosphotransferase system, HPr  51.25 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2778  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.25 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2861  HPr family phosphocarrier protein  51.25 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0530  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0602783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2161  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.41 
 
 		 88 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0147  HPrNtr  44.19 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4185  HPrNtr  50 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0412  phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889761  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0157  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.07 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2916  HPr family phosphocarrier protein  50 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0720  phosphoryl transfer system, HPr  47.62 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0540  hypothetical protein  48.75 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0516  hypothetical protein  48.75 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1657  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.99 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.769211 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0219  HPrNtr  44.05 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2052  HPrNtr  52.17 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.67872  normal  0.126322 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0170  phosphocarrier, HPr family  44.94 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0744  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.24 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0152  HPrNtr  44.94 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28673  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0159  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.94 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2902  HPrNtr  52.87 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.193803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1288  HPrNtr  45.88 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12196  hitchhiker  0.00000200864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0238  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.5 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  0.320844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2966  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.15 
 
 		 88 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.351605  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0572  HPr family phosphocarrier protein  41.86 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2719  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.35 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2420  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.68 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.11815 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1031  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.25 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002399  phosphocarrier protein nitrogen regulation associated  40.91 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3385  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.05 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0665  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.71 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1900  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.19 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0610024 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0751  phosphotransferase system HPr enzyme  43.53 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2760  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.45 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4897  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.43 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0408  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.75 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0980  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.06 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1912  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.53 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0324  phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273003  normal  0.0186594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0298  HPrNtr  48.75 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>