More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1288 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1288  HPrNtr  100 
 
 		 88 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12196  hitchhiker  0.00000200864 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1882  phosphocarrier protein HPr  81.82 
 
 		 88 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2966  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  76.14 
 
 		 88 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.351605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2161  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  72.73 
 
 		 88 aa  134  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3385  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  73.86 
 
 		 88 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0874  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  73.86 
 
 		 88 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0980  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  76.14 
 
 		 88 aa  120  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1930  phosphocarrier protein HPr  64.37 
 
 		 95 aa  114  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000294443  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0665  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  57.95 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0751  phosphotransferase system HPr enzyme  56.82 
 
 		 89 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0170  phosphocarrier, HPr family  55.06 
 
 		 90 aa  103  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0159  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.06 
 
 		 90 aa  103  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0152  HPrNtr  53.93 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28673  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.41 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  55.68 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2420  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.82 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.11815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0157  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.94 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0412  phosphocarrier protein HPr  55.17 
 
 		 89 aa  98.2  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889761  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2799  phosphoryl transfer system, HPr  58.43 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6190  HPrNtr  55.17 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2778  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.17 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2247  phosphotransferase system, HPr  55.17 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2872  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.17 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2861  HPr family phosphocarrier protein  55.17 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0219  HPrNtr  55.17 
 
 		 89 aa  95.9  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2916  HPr family phosphocarrier protein  55.17 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0222  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.32 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000064621 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0442  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.17 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0261  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.17 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1406  phosphocarrier protein HPr  54.02 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3212  phosphocarrier protein HPr  54.02 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0657  phosphocarrier protein HPr  54.02 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0130  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.72 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0517698 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0186  phosphocarrier protein HPr  54.02 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0473  phosphocarrier protein HPr  54.02 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0492  phosphocarrier protein HPr  54.02 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2833  phosphocarrier protein HPr  54.02 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858125  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0540  hypothetical protein  55.17 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0516  hypothetical protein  55.17 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0203  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.17 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.268008 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0744  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.32 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0147  HPrNtr  55.17 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0245  hypothetical protein  55.17 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.41 
 
 		 88 aa  94  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0530  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.02 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0602783  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0347  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase  56.32 
 
 		 89 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4185  HPrNtr  54.02 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02220  phosphotransferase system HPr enzyme  51.14 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340612  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0296  phosphoryl transfer system, HPr  54.02 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0720  phosphoryl transfer system, HPr  52.87 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0254  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.87 
 
 		 88 aa  90.5  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1869  HPrNtr  51.72 
 
 		 88 aa  90.1  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0948  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.86 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2283  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47392  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0948  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.55 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0955  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.55 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3575  HPr family phosphocarrier protein  47.73 
 
 		 101 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5039  phosphocarrier protein HPr  55.95 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.37142  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0987  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.55 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3446  HPrNtr  50.59 
 
 		 112 aa  85.9  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0467  HPrNtr  47.13 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.319274  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.85 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57980  putative phosphoryl carrier protein  55.95 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5437  phosphocarrier, HPr family  50.59 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4267  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.27 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4083  phosphoryl transfer system, HPr  50.57 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2132  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.72 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595795  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2719  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50.57 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12750  Phosphocarrier NPr protein  53.93 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0371  phosphotransferase system, HPr  49.43 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255941 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2307  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 88 aa  84.3  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0458616  normal  0.112243 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2076  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.86 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0357  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.28 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2443  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.41 
 
 		 103 aa  84.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7372  PTS system phosphocarrier protein HPr  49.43 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0468  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.85 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.278707  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0167  HPrNtr  47.73 
 
 		 88 aa  83.6  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.874306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0866  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.41 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176719  normal  0.959659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0238  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50.57 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  0.320844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4457  phosphocarrier protein HPr  55.29 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.576235  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1657  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.01 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.769211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4626  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.86 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4151  phosphocarrier HPr protein  54.55 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1031  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50.57 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2849  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.4 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531241  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2234  HPr family phosphocarrier protein  48.81 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2095  phosphocarrier protein HPr  44.83 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1952  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.81 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2014  phosphocarrier protein HPr  44.83 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.205162  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0224  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.68 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0229  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.06 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0207173 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0824  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.83 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1209  phosphocarrier protein HPr  46.59 
 
 		 89 aa  80.1  0.000000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0756  phosphocarrier protein HPr  46.59 
 
 		 89 aa  80.1  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2848  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.81 
 
 		 96 aa  80.1  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3248  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.98 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4897  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.13 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2560  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.45 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0115  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.38 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.158465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0117  HPrNtr domain-containing protein  46.59 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.668749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>