More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4626 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4626  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  100 
 
 
92 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563542  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0371  phosphotransferase system, HPr  59.3 
 
 
111 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0255941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0467  HPrNtr  56.98 
 
 
108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.319274  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0357  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.98 
 
 
110 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0824  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.98 
 
 
104 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0347  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase  55.17 
 
 
89 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0222  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.02 
 
 
89 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064621 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0439  HPrNtr  61.63 
 
 
113 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0245  hypothetical protein  54.02 
 
 
89 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0203  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.87 
 
 
89 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.268008 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0048  phosphocarrier protein HPr  58.14 
 
 
91 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3446  HPrNtr  61.18 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3575  HPr family phosphocarrier protein  56.98 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2095  phosphocarrier protein HPr  54.65 
 
 
104 aa  99.4  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2014  phosphocarrier protein HPr  54.65 
 
 
104 aa  99.4  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.205162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0593  HPrNtr  56.63 
 
 
112 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.040328  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0296  phosphoryl transfer system, HPr  54.02 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0444  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  61.9 
 
 
99 aa  97.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7372  PTS system phosphocarrier protein HPr  56.98 
 
 
109 aa  97.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0442  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.72 
 
 
89 aa  96.7  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293204  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2849  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  60 
 
 
126 aa  96.7  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531241  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3182  HNH nuclease  52.87 
 
 
89 aa  96.7  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2833  phosphocarrier protein HPr  52.87 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858125  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2778  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.72 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3212  phosphocarrier protein HPr  52.87 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0473  phosphocarrier protein HPr  52.87 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0344  phosphoryl transfer system, HPr  60.24 
 
 
109 aa  95.9  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155438 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0657  phosphocarrier protein HPr  52.87 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2872  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.72 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1406  phosphocarrier protein HPr  52.87 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2247  phosphotransferase system, HPr  51.72 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0251  phosphocarrier, HPr family  56.47 
 
 
111 aa  96.3  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0492  phosphocarrier protein HPr  52.87 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2861  HPr family phosphocarrier protein  51.72 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0186  phosphocarrier protein HPr  52.87 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  55.06 
 
 
89 aa  94.7  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2916  HPr family phosphocarrier protein  50.57 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 
88 aa  94.7  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0412  phosphocarrier protein HPr  50.57 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889761  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.41 
 
 
89 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1952  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50.57 
 
 
89 aa  94  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6190  HPrNtr  50.57 
 
 
89 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0261  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50.57 
 
 
89 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2436  phosphotransferase system, HPr  52.87 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.119206  normal  0.979343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3248  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.49 
 
 
97 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4897  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.28 
 
 
89 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0530  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.43 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0602783  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0468  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  58.75 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.278707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0229  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.94 
 
 
106 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0207173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4185  HPrNtr  49.43 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1657  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.43 
 
 
89 aa  90.5  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.769211 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0077  HPr family phosphocarrier protein  52.75 
 
 
91 aa  90.5  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.984139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0541  HPrNtr  53.49 
 
 
93 aa  90.1  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5437  phosphocarrier, HPr family  51.76 
 
 
106 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0744  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50.57 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0397  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.47 
 
 
90 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.081426  normal  0.0975704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5039  phosphocarrier protein HPr  50 
 
 
90 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.37142  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2234  HPr family phosphocarrier protein  51.72 
 
 
119 aa  87.8  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2387  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.41 
 
 
105 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357738  hitchhiker  0.00387358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2760  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.76 
 
 
93 aa  87.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2902  HPrNtr  55.56 
 
 
102 aa  87  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.193803  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0540  hypothetical protein  47.13 
 
 
89 aa  87  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0516  hypothetical protein  47.13 
 
 
89 aa  87  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0115  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  63.1 
 
 
101 aa  86.7  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.158465  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57980  putative phosphoryl carrier protein  50 
 
 
90 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1930  phosphocarrier protein HPr  50.57 
 
 
95 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000294443  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1900  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.95 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0610024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0238  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.94 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  0.320844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0207  phosphotransferase system  48.28 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0853  HPrNtr  50.56 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.914753 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0147  HPrNtr  45.98 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0720  phosphoryl transfer system, HPr  51.72 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2161  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2737  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.41 
 
 
124 aa  84.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0535175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0682  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.43 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.520502  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0712  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.43 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0372719  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3672  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.43 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0025895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4292  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.65 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0353  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.43 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000307134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4151  phosphocarrier HPr protein  48.86 
 
 
90 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1031  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50.57 
 
 
89 aa  84  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0711  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.43 
 
 
91 aa  83.6  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145136  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4457  phosphocarrier protein HPr  48.86 
 
 
90 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.576235  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3353  HPr family phosphocarrier protein  47.62 
 
 
91 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.056229  normal  0.054295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0668  HPr family phosphocarrier protein  47.62 
 
 
91 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0597918  normal  0.15009 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3965  phosphocarrier protein NPR  47.62 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3965  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.65 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0408  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.98 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0219  HPrNtr  45.98 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3385  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.32 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0669  HPr family phosphocarrier protein  46.43 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0255747  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0987  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.86 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1882  phosphocarrier protein HPr  48.86 
 
 
88 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0948  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.86 
 
 
90 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2799  phosphoryl transfer system, HPr  47.73 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.18 
 
 
88 aa  82  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0319  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.27 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.734437  normal  0.80364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1234  HPr family phosphocarrier protein  50.59 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0955  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.86 
 
 
90 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38141  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2719  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.83 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>