More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0593 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0593  HPrNtr  100 
 
 		 112 aa  224  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.040328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0357  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  72.73 
 
 		 110 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0371  phosphotransferase system, HPr  68.75 
 
 		 111 aa  153  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0467  HPrNtr  69.64 
 
 		 108 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.319274  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0439  HPrNtr  69.03 
 
 		 113 aa  131  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0344  phosphoryl transfer system, HPr  66.67 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7372  PTS system phosphocarrier protein HPr  60.38 
 
 		 109 aa  120  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2849  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  58.26 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531241  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2387  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  63.53 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357738  hitchhiker  0.00387358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5437  phosphocarrier, HPr family  62.5 
 
 		 106 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2014  phosphocarrier protein HPr  58.42 
 
 		 104 aa  114  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.205162  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2095  phosphocarrier protein HPr  58.42 
 
 		 104 aa  114  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0229  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  63.53 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0207173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3248  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  60.44 
 
 		 97 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1396  phosphocarrier, HPr family  66.67 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.135473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1234  HPr family phosphocarrier protein  66.67 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0824  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.19 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0048  phosphocarrier protein HPr  63.1 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3575  HPr family phosphocarrier protein  59.77 
 
 		 101 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2916  HPr family phosphocarrier protein  60.24 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1406  phosphocarrier protein HPr  60.24 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0492  phosphocarrier protein HPr  60.24 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3212  phosphocarrier protein HPr  60.24 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0657  phosphocarrier protein HPr  60.24 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2833  phosphocarrier protein HPr  60.24 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0473  phosphocarrier protein HPr  60.24 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0186  phosphocarrier protein HPr  60.24 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2872  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  59.04 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2247  phosphotransferase system, HPr  59.04 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2778  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  59.04 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2861  HPr family phosphocarrier protein  59.04 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0442  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  57.83 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0412  phosphocarrier protein HPr  59.04 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889761  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6190  HPrNtr  57.83 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0261  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.63 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0251  phosphocarrier, HPr family  51.76 
 
 		 111 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4292  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  64.77 
 
 		 91 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3965  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  64.77 
 
 		 91 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4185  HPrNtr  55.42 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0530  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.42 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0602783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2737  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.57 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0535175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4626  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.63 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3446  HPrNtr  59.26 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1952  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.87 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1175  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  66.67 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0245  hypothetical protein  55 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.19 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0541  HPrNtr  51.72 
 
 		 93 aa  94.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0296  phosphoryl transfer system, HPr  55 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2848  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.33 
 
 		 96 aa  94  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2560  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.57 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0222  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.4 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000064621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0203  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.4 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.268008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0347  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase  49.4 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1657  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.43 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.769211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0115  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  61.18 
 
 		 101 aa  92.8  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.158465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0319  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.19 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.734437  normal  0.80364 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0353  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.33 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000307134 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1900  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.22 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0610024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  50 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0397  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  57.14 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.081426  normal  0.0975704 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.59 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2799  phosphoryl transfer system, HPr  47.06 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0219  HPrNtr  45.88 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0207  phosphotransferase system  50 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0147  HPrNtr  46.51 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0468  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50.62 
 
 		 89 aa  87.4  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.278707  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4897  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  87.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0408  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.67 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0324  phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273003  normal  0.0186594 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2760  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.33 
 
 		 93 aa  85.5  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0444  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.31 
 
 		 99 aa  84.3  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4083  phosphoryl transfer system, HPr  45.35 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0077  HPr family phosphocarrier protein  43.82 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.984139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0238  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.67 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  0.320844 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1031  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0291  phosphocarrier, HPr family  46.51 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2436  phosphotransferase system, HPr  50 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.119206  normal  0.979343 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0540  hypothetical protein  43.18 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0516  hypothetical protein  43.18 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0720  phosphoryl transfer system, HPr  46.51 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0744  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0296  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.51 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0298  HPrNtr  51.25 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2234  HPr family phosphocarrier protein  51.25 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1686  putative phosphocarrier HPr protein  51.19 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.842664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1930  phosphocarrier protein HPr  46.34 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000294443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1288  HPrNtr  48.81 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12196  hitchhiker  0.00000200864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2161  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.62 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57980  putative phosphoryl carrier protein  48.84 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3182  HNH nuclease  42.17 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20160  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.77 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.88 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1882  phosphocarrier protein HPr  46.43 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0756  phosphocarrier protein HPr  40.23 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2052  HPrNtr  48.35 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.67872  normal  0.126322 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1209  phosphocarrier protein HPr  40.23 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5039  phosphocarrier protein HPr  47.67 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.37142  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1912  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.55 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3385  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.81 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>