More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0222 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0222  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  100 
 
 		 89 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000064621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0203  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  98.88 
 
 		 89 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.268008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0347  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase  96.63 
 
 		 89 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0245  hypothetical protein  83.15 
 
 		 89 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0296  phosphoryl transfer system, HPr  83.15 
 
 		 89 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2872  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  73.03 
 
 		 89 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2778  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  73.03 
 
 		 89 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2247  phosphotransferase system, HPr  73.03 
 
 		 89 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2861  HPr family phosphocarrier protein  73.03 
 
 		 89 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1406  phosphocarrier protein HPr  71.91 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3212  phosphocarrier protein HPr  71.91 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0657  phosphocarrier protein HPr  71.91 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0492  phosphocarrier protein HPr  71.91 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2916  HPr family phosphocarrier protein  71.91 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2833  phosphocarrier protein HPr  71.91 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0186  phosphocarrier protein HPr  71.91 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0473  phosphocarrier protein HPr  71.91 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0442  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  71.91 
 
 		 89 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6190  HPrNtr  71.91 
 
 		 89 aa  137  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0412  phosphocarrier protein HPr  71.91 
 
 		 89 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889761  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0261  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  71.91 
 
 		 89 aa  135  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4185  HPrNtr  70.79 
 
 		 89 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0530  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  70.79 
 
 		 89 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0602783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1657  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  74.12 
 
 		 89 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.769211 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1952  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  74.12 
 
 		 89 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0408  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  66.29 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0147  HPrNtr  68.54 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4897  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  64.04 
 
 		 89 aa  124  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  68.97 
 
 		 89 aa  123  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4083  phosphoryl transfer system, HPr  66.29 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0353  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  64.04 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000307134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0238  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  62.92 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  0.320844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2719  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  65.17 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0291  phosphocarrier, HPr family  61.8 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1031  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  61.8 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0219  HPrNtr  61.8 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0296  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  60.67 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0324  phosphocarrier protein HPr  60.67 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273003  normal  0.0186594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0298  HPrNtr  61.8 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0468  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  60.67 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.278707  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0540  hypothetical protein  58.43 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0516  hypothetical protein  58.43 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2799  phosphoryl transfer system, HPr  55.06 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0371  phosphotransferase system, HPr  53.41 
 
 		 111 aa  103  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255941 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0751  phosphotransferase system HPr enzyme  55.17 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0665  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.17 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4626  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.02 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.87 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0467  HPrNtr  53.41 
 
 		 108 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.319274  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0357  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.14 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0720  phosphoryl transfer system, HPr  55.06 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3385  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.32 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2161  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.17 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4267  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  57.78 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1281  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.18 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0756  phosphocarrier protein HPr  52.87 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1209  phosphocarrier protein HPr  52.87 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0987  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  57.78 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0948  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.87 
 
 		 89 aa  97.4  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1882  phosphocarrier protein HPr  55.17 
 
 		 88 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0948  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  57.78 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4151  phosphocarrier HPr protein  56.67 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3182  HNH nuclease  51.69 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0955  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  57.78 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2966  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.32 
 
 		 88 aa  97.1  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.351605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0874  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.17 
 
 		 88 aa  96.7  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1288  HPrNtr  56.32 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12196  hitchhiker  0.00000200864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57980  putative phosphoryl carrier protein  55.81 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4457  phosphocarrier protein HPr  56.67 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.576235  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50.57 
 
 		 88 aa  94.7  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0744  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.06 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2420  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.44 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.11815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0866  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.33 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176719  normal  0.959659 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0130  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0517698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0439  HPrNtr  48.86 
 
 		 113 aa  93.6  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0669  HPr family phosphocarrier protein  49.43 
 
 		 91 aa  93.2  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0255747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02220  phosphotransferase system HPr enzyme  50.57 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0593  HPrNtr  49.4 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.040328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3353  HPr family phosphocarrier protein  48.28 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.056229  normal  0.054295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0668  HPr family phosphocarrier protein  48.28 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0597918  normal  0.15009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5039  phosphocarrier protein HPr  54.65 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.37142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3965  phosphocarrier protein NPR  48.28 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0712  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.43 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0372719  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0682  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.43 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.520502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3672  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.43 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0025895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1930  phosphocarrier protein HPr  52.87 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000294443  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0711  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.43 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0703  phosphocarrier, HPr family  48.28 
 
 		 91 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.45808 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3092  phosphocarrier protein NPR  47.67 
 
 		 91 aa  90.1  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429943  normal  0.129077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0602  HPrNtr  58.43 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3315  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.98 
 
 		 91 aa  88.6  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.297486  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4244  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.13 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  hitchhiker  0.000000216421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2849  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.86 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531241  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0444  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.84 
 
 		 99 aa  87.8  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0853  HPrNtr  54.44 
 
 		 91 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914753 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0722  phosphocarrier protein NPR  45.98 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.118934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2760  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.34 
 
 		 93 aa  87.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0048  phosphocarrier protein HPr  47.67 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0485  phosphotransferase system, HPr  43.68 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.467636  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2132  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.07 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>