More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0229 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0229  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  100 
 
 
106 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0207173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5437  phosphocarrier, HPr family  83.96 
 
 
106 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2387  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  78.35 
 
 
105 aa  154  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357738  hitchhiker  0.00387358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1234  HPr family phosphocarrier protein  77.89 
 
 
107 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1396  phosphocarrier, HPr family  77.89 
 
 
107 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.135473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7372  PTS system phosphocarrier protein HPr  61.68 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1175  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  76.84 
 
 
107 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0467  HPrNtr  60 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.319274  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2737  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  61.29 
 
 
124 aa  116  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0535175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0371  phosphotransferase system, HPr  55 
 
 
111 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0255941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2849  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  63.16 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531241  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0593  HPrNtr  63.53 
 
 
112 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.040328  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0439  HPrNtr  60.19 
 
 
113 aa  114  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0357  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  60.92 
 
 
110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0344  phosphoryl transfer system, HPr  58.1 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0251  phosphocarrier, HPr family  57.61 
 
 
111 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3248  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.35 
 
 
97 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3446  HPrNtr  56.67 
 
 
112 aa  102  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2095  phosphocarrier protein HPr  52.75 
 
 
104 aa  100  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2014  phosphocarrier protein HPr  52.75 
 
 
104 aa  100  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.205162  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0824  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.85 
 
 
104 aa  99.4  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.76 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3575  HPr family phosphocarrier protein  51.02 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0319  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.29 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.734437  normal  0.80364 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2560  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.12 
 
 
89 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0048  phosphocarrier protein HPr  51.76 
 
 
91 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4626  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  52.94 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563542  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2799  phosphoryl transfer system, HPr  48.86 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2848  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.65 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0540  hypothetical protein  48.24 
 
 
89 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0516  hypothetical protein  48.24 
 
 
89 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0541  HPrNtr  47.83 
 
 
93 aa  87.8  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1900  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.57 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0610024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4292  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  58.14 
 
 
91 aa  87.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0115  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  60.22 
 
 
101 aa  87  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.158465  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3965  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  58.14 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1930  phosphocarrier protein HPr  51.19 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000294443  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2436  phosphotransferase system, HPr  50 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.119206  normal  0.979343 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0207  phosphotransferase system  51.76 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2161  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.88 
 
 
88 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0347  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase  43.02 
 
 
89 aa  84  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1686  putative phosphocarrier HPr protein  55.29 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.842664  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0245  hypothetical protein  46.51 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0152  HPrNtr  48.81 
 
 
90 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28673  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0665  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.71 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0751  phosphotransferase system HPr enzyme  43.53 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0744  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.81 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1882  phosphocarrier protein HPr  44.71 
 
 
88 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0170  phosphocarrier, HPr family  48.81 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0159  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.81 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0296  phosphoryl transfer system, HPr  46.51 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0468  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50.6 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.278707  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0219  HPrNtr  40.7 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0203  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.86 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.268008 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0222  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.86 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064621 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1288  HPrNtr  47.06 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12196  hitchhiker  0.00000200864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0157  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.43 
 
 
90 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2916  HPr family phosphocarrier protein  43.02 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.18 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0077  HPr family phosphocarrier protein  46.59 
 
 
91 aa  80.1  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.984139 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2778  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.86 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0442  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.86 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293204  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2247  phosphotransferase system, HPr  41.86 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2872  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.86 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2861  HPr family phosphocarrier protein  41.86 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2966  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.71 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.351605  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0412  phosphocarrier protein HPr  41.86 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889761  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0397  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.24 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.081426  normal  0.0975704 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2420  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.67 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.11815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6190  HPrNtr  40.7 
 
 
89 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0147  HPrNtr  39.53 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2833  phosphocarrier protein HPr  40.7 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0473  phosphocarrier protein HPr  40.7 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3212  phosphocarrier protein HPr  40.7 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0657  phosphocarrier protein HPr  40.7 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1406  phosphocarrier protein HPr  40.7 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0492  phosphocarrier protein HPr  40.7 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0186  phosphocarrier protein HPr  40.7 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02220  phosphotransferase system HPr enzyme  45.88 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340612  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  42.35 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0948  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.88 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0720  phosphoryl transfer system, HPr  43.02 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1657  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.18 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.769211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3182  HNH nuclease  41.86 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  38.55 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1952  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  41.18 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2902  HPrNtr  46.32 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.193803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2719  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.02 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2052  HPrNtr  49.41 
 
 
92 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.67872  normal  0.126322 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3385  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.05 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4094  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.78 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0707453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0261  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  37.21 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0530  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.05 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0602783  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4185  HPrNtr  36.05 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0444  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.35 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0238  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.37 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  0.320844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4083  phosphoryl transfer system, HPr  40 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5039  phosphocarrier protein HPr  45.45 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.37142  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4267  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.45 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0874  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.86 
 
 
88 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>