128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0438 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0438  chorismate mutase  100 
 
 		 295 aa  578  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3265  chorismate mutase  37.86 
 
 		 286 aa  148  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1582  chorismate mutase  33.33 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4282  hypothetical protein  34.04 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.588567  normal  0.0727138 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0584  hypothetical protein  30.52 
 
 		 284 aa  96.3  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1107  hypothetical protein  33.02 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.300512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0675  hypothetical protein  33.51 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1184  hypothetical protein  33.51 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.67 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0728  hypothetical protein  31.63 
 
 		 283 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347546  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4100  hypothetical protein  33.71 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4253  hypothetical protein  33.71 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4926  hypothetical protein  32.57 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0306  hypothetical protein  32.61 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.237508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0395  hypothetical protein  33 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0794895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1207  hypothetical protein  31.64 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00789848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  30.46 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  30.2 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  34.13 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  32.64 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  29.53 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  31.69 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  32.67 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3227  hypothetical protein  33.98 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20015 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.87 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  29.06 
 
 		 367 aa  67  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  30.34 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.53 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  28.06 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  29.86 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.68 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  34.68 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  37.11 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  32.26 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  28.86 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  30.2 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  28.19 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  29.87 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  31.29 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  36 
 
 		 413 aa  62  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  29.5 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  35.87 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  26.15 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  29.5 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  33.33 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  26.95 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  28.87 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  27.89 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  31.72 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  37.38 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  27.63 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  30.25 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  33.09 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2147  prephenate dehydratase  28.97 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.707843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  34.83 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  27.08 
 
 		 365 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  31.97 
 
 		 366 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  30.38 
 
 		 706 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  27.08 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  28.17 
 
 		 419 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  35.71 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.86 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.82 
 
 		 360 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  34.09 
 
 		 365 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  26.62 
 
 		 357 aa  53.9  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.69 
 
 		 357 aa  53.5  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  40.96 
 
 		 397 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  26.62 
 
 		 357 aa  53.1  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  31.82 
 
 		 360 aa  53.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  26.62 
 
 		 357 aa  53.1  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  39.02 
 
 		 357 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  32.04 
 
 		 371 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  28.39 
 
 		 368 aa  52.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  32.58 
 
 		 359 aa  52.8  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1297  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  28.57 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  27.27 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  28.67 
 
 		 359 aa  51.6  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  31.96 
 
 		 374 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  31.96 
 
 		 374 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  29.66 
 
 		 358 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  31.82 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1792  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  31.17 
 
 		 363 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  25.49 
 
 		 382 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1827  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  31.17 
 
 		 363 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.124092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33 
 
 		 387 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  34.67 
 
 		 356 aa  50.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  29.29 
 
 		 360 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  33.72 
 
 		 377 aa  49.7  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1644  Prephenate dehydratase  29.71 
 
 		 355 aa  50.1  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.241055  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  31.07 
 
 		 371 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  35.63 
 
 		 382 aa  49.7  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.27 
 
 		 365 aa  49.7  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  24.31 
 
 		 355 aa  49.3  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  27.21 
 
 		 360 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  31.25 
 
 		 360 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1618  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  28.57 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  27.97 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  31.11 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  31.33 
 
 		 372 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  26.28 
 
 		 371 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>