130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3227 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3227  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  511  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20015 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3265  chorismate mutase  35.14 
 
 		 286 aa  112  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0438  chorismate mutase  33.98 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1582  chorismate mutase  32.35 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  41.41 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0675  hypothetical protein  30.98 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.31 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1207  hypothetical protein  33.05 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00789848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0306  hypothetical protein  36.63 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.237508 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.39 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  41.44 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4926  hypothetical protein  30.95 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0728  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347546  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  39.78 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1107  hypothetical protein  32.33 
 
 		 283 aa  62  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.300512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  37.11 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  37.11 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  36.46 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.11 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1184  hypothetical protein  32.99 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4282  hypothetical protein  31.49 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.588567  normal  0.0727138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4100  hypothetical protein  30.73 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.63 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  36.63 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  40.43 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  32.73 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  37.62 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  37.5 
 
 		 365 aa  58.9  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  39.18 
 
 		 363 aa  58.9  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0395  hypothetical protein  32.56 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0794895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  38.3 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4253  hypothetical protein  30.73 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  36.56 
 
 		 360 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.3 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.82 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.6 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  39.66 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.91 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0584  hypothetical protein  30.11 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.56 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  34.34 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  28.05 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  34.74 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  34.34 
 
 		 365 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.74 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.66 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  33.33 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  33.33 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  46.34 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  34.41 
 
 		 399 aa  55.8  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  39.73 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  41.05 
 
 		 370 aa  55.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  33.33 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  39.18 
 
 		 391 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  26.72 
 
 		 359 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  38.61 
 
 		 706 aa  53.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  35.34 
 
 		 382 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  39.73 
 
 		 371 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  35.79 
 
 		 413 aa  52.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  32.03 
 
 		 373 aa  52.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  32.29 
 
 		 365 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  32.29 
 
 		 365 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  25.87 
 
 		 357 aa  52.4  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  30.53 
 
 		 364 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  36.36 
 
 		 355 aa  52  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  32 
 
 		 393 aa  52  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  30.53 
 
 		 364 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  34.41 
 
 		 366 aa  51.2  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  31 
 
 		 393 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  30.53 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  30.53 
 
 		 364 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  35.05 
 
 		 419 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  30.53 
 
 		 364 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  29.47 
 
 		 364 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.44 
 
 		 371 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  31.19 
 
 		 359 aa  50.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  38.3 
 
 		 372 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  35.16 
 
 		 355 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.7 
 
 		 360 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  34.65 
 
 		 379 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.7 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  33.7 
 
 		 360 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0564  chorismate mutase  33.7 
 
 		 362 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  36.17 
 
 		 359 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  33.7 
 
 		 360 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1043  chorismate mutase  33.7 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  30.11 
 
 		 358 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  33.7 
 
 		 360 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  36.25 
 
 		 360 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2767  chorismate mutase  26.56 
 
 		 357 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.642402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  33.68 
 
 		 397 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  36.17 
 
 		 359 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  28.68 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>