More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0781 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
313 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
313 aa  289  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.44 
 
 
313 aa  241  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.284622  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.781235  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
313 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.22 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
313 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
318 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  36.27 
 
 
298 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
317 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.627017 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3891  ABC di/oligopeptide transporter, inner membrane subunit  34.73 
 
 
317 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27810  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.75 
 
 
322 aa  192  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  36.22 
 
 
314 aa  189  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0231  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.81 
 
 
318 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
305 aa  189  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
314 aa  189  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5642  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  37.18 
 
 
316 aa  188  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2266  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.67 
 
 
305 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0437136  normal  0.510815 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
315 aa  188  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2575  peptide ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 
305 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
336 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00484259  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
313 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  34.94 
 
 
313 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
318 aa  186  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
313 aa  186  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  normal  0.480947 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  32.59 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.59 
 
 
316 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
318 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.59 
 
 
316 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
313 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  36.04 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18831  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  32.83 
 
 
339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.31 
 
 
313 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 
306 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
313 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
335 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  32.17 
 
 
306 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  32.17 
 
 
306 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
316 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
313 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.589529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  32.51 
 
 
306 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  32.51 
 
 
306 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
305 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31067  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.59 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6675  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  0.593084 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2371  peptide ABC transporter, permease protein, putative  30.38 
 
 
311 aa  179  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
315 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.24032  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  31.65 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
317 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
315 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
390 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
311 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 
316 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4849  ABC transporter, permease  37.42 
 
 
310 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315179  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
311 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277015  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
312 aa  179  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
313 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.50651  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
317 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0207094 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
329 aa  178  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
313 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0752  ABC transporter, permease  36.86 
 
 
320 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 
313 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  31.99 
 
 
318 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  31.99 
 
 
318 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
315 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0249  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.99 
 
 
318 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
313 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
315 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000049983  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
313 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
306 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
315 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.63 
 
 
316 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  31.33 
 
 
316 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
322 aa  175  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  31.33 
 
 
316 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
306 aa  175  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
318 aa  175  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
311 aa  175  9e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
313 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
313 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
324 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.507532  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  32.37 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13220  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.41 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  32.37 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>