More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2542 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 311 aa  623  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277015  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 311 aa  623  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2371  peptide ABC transporter, permease protein, putative  81.03 
 
 		 311 aa  535  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0021  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  36.22 
 
 		 311 aa  220  3e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00143513  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 		 312 aa  218  7.999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.184188  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3761  nickel transporter permease NikB  35.03 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03326  nickel transporter subunit  35.03 
 
 		 314 aa  205  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0238  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  35.03 
 
 		 314 aa  205  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03279  hypothetical protein  35.03 
 
 		 314 aa  205  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3676  nickel transporter permease NikB  35.03 
 
 		 314 aa  205  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3844  nickel transporter permease NikB  35.03 
 
 		 314 aa  205  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0239  nickel transporter permease NikB  35.03 
 
 		 314 aa  205  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3959  nickel transporter permease NikB  35.03 
 
 		 314 aa  205  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4817  nickel transporter permease NikB  35.03 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  35.81 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0169288  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2276  nickel transporter permease NikB  34.6 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293593  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2575  peptide ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2266  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.71 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0437136  normal  0.510815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1835  nickel transporter permease NikB  35.03 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.829834  hitchhiker  0.0019148 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1322  nickel transport system permease protein NikB  35.6 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00196564  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3006  nickel transporter permease NikB  36.33 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0438476  normal  0.3014 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  32.35 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.4 
 
 		 317 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3343  nickel transporter permease NikB  35.37 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3675  oligopeptide ABC transporter, permease  33.66 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0490538 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0366  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  36.94 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 		 317 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0790804 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7614  nickel transporter permease NikB  34.08 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  33.66 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2702  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 		 317 aa  185  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6075  nickel transporter permease NikB  33.44 
 
 		 319 aa  185  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 		 306 aa  185  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 321 aa  185  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 		 314 aa  185  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  32.79 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  32.79 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  32.79 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7149  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  32.26 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507762  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  32.79 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  33.44 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.44 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  32.41 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33.44 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  33.44 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33.44 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33.44 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0803  nickel transporter permease NikB  33.12 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 		 305 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.507532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 		 316 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0753  nickel transporter permease NikB  33.12 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  normal  0.480947 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.396259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33.44 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0953  peptide ABC transporter, permease protein, putative  35.06 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.353357  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  34.42 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  32.71 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.583843  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 		 317 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33.12 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0219662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  33.12 
 
 		 316 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 		 311 aa  179  8e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0375695  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0415626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.913097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  32.47 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 		 306 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 		 321 aa  176  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 		 321 aa  176  6e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 305 aa  175  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1114  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  32.79 
 
 		 327 aa  175  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 		 306 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221048  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>