49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2265 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2176  hypothetical protein  96.13 
 
 		 587 aa  925    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.1659  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1680  hypothetical protein  91.57 
 
 		 587 aa  847    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441458  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2265  hypothetical protein  100 
 
 		 586 aa  1121    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.030123  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2124  secretin/TonB short domain  53.38 
 
 		 575 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0909641  normal  0.0183027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  31.73 
 
 		 634 aa  89.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0114  hypothetical protein  31.41 
 
 		 291 aa  72  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0503124  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1143  protein of unknown function DUF583  27.92 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.258577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3511  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0381375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2043  hypothetical protein  22.64 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000518582  hitchhiker  0.00000000582876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3298  hypothetical protein  25.23 
 
 		 354 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.434955  normal  0.603732 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0026  hypothetical protein  31.72 
 
 		 361 aa  54.7  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  24.86 
 
 		 894 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2632  hypothetical protein  29.03 
 
 		 284 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.90929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3733  hypothetical protein  28.16 
 
 		 294 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02280  hypothetical protein  31.63 
 
 		 223 aa  52.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  30.3 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  30.3 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  30.3 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  30.3 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  30.3 
 
 		 412 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  30.3 
 
 		 412 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  31.52 
 
 		 386 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  26.47 
 
 		 870 aa  51.2  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  28.46 
 
 		 926 aa  51.2  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  29.29 
 
 		 412 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  25.25 
 
 		 944 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  29.29 
 
 		 412 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  27.69 
 
 		 946 aa  50.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0346  protein of unknown function DUF583  28.96 
 
 		 348 aa  48.5  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  30.25 
 
 		 657 aa  48.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  30.69 
 
 		 721 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  30.69 
 
 		 721 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3843  hypothetical protein  29.35 
 
 		 315 aa  47.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262125  decreased coverage  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  29.7 
 
 		 714 aa  47.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  28.1 
 
 		 668 aa  47.4  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  28.26 
 
 		 784 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  29.77 
 
 		 987 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  28.26 
 
 		 784 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  29.03 
 
 		 723 aa  47  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  31.94 
 
 		 887 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  31.94 
 
 		 887 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  26.88 
 
 		 891 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  31.94 
 
 		 893 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1911  hypothetical protein  28.57 
 
 		 366 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0206  type IV pilus assembly protein PilQ  28.38 
 
 		 745 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  30.56 
 
 		 882 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1038  hypothetical protein  24.68 
 
 		 357 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  26.32 
 
 		 729 aa  45.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  29.67 
 
 		 655 aa  44.3  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>