50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_2176 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2265  hypothetical protein  96.35 
 
 
586 aa  909    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.030123  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2176  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1124    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.1659  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1680  hypothetical protein  94.3 
 
 
587 aa  877    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441458  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2124  secretin/TonB short domain  53.19 
 
 
575 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0909641  normal  0.0183027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  31 
 
 
634 aa  87  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0114  hypothetical protein  30.04 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0503124  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1143  protein of unknown function DUF583  28.48 
 
 
356 aa  61.2  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.258577  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3511  hypothetical protein  33.99 
 
 
167 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0381375  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3298  hypothetical protein  25.8 
 
 
354 aa  57.4  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.434955  normal  0.603732 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0026  hypothetical protein  31.51 
 
 
361 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2043  hypothetical protein  21.89 
 
 
296 aa  54.3  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000518582  hitchhiker  0.00000000582876 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02280  hypothetical protein  31.63 
 
 
223 aa  53.5  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  31.31 
 
 
412 aa  53.5  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  31.31 
 
 
412 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  31.31 
 
 
412 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3733  hypothetical protein  29.03 
 
 
294 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  31.31 
 
 
412 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  31.31 
 
 
412 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  31.31 
 
 
412 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  32.61 
 
 
386 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  24.28 
 
 
894 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0346  protein of unknown function DUF583  28.96 
 
 
348 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  30.3 
 
 
412 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  30.3 
 
 
412 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  27.69 
 
 
926 aa  50.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  27.4 
 
 
870 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1550  type IV pilus secretin PilQ  26.92 
 
 
946 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  31.09 
 
 
657 aa  48.5  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  25.49 
 
 
944 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3249  type IV pilus secretin PilQ  32.39 
 
 
721 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2902  type IV pilus secretin PilQ  32.39 
 
 
721 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.123013 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1038  hypothetical protein  25 
 
 
357 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  26.88 
 
 
891 aa  48.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  30.99 
 
 
714 aa  47.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  30.56 
 
 
887 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  29.82 
 
 
729 aa  46.6  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2632  hypothetical protein  27.19 
 
 
284 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.90929  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0735  fimbrial assembly protein PilQ, putative  28.26 
 
 
784 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0883  type IV pilus secretin PilQ  28.26 
 
 
784 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126317  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  30.56 
 
 
887 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3843  hypothetical protein  27.87 
 
 
315 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262125  decreased coverage  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  31.18 
 
 
655 aa  46.2  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  27.27 
 
 
668 aa  46.2  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  30.56 
 
 
893 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0206  type IV pilus assembly protein PilQ  27.03 
 
 
745 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  29.17 
 
 
882 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  27.96 
 
 
723 aa  45.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1911  hypothetical protein  27.53 
 
 
366 aa  44.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  25.35 
 
 
706 aa  43.9  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  25.35 
 
 
710 aa  43.5  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>