More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2203 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  96.98 
 
 
232 aa  474  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  51.52 
 
 
232 aa  260  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  44.4 
 
 
232 aa  230  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  43.72 
 
 
231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  41.05 
 
 
234 aa  184  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  37.5 
 
 
243 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  36.64 
 
 
244 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  36.64 
 
 
244 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  36.64 
 
 
244 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  37.66 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  37.23 
 
 
240 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  36.8 
 
 
240 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  37.66 
 
 
241 aa  165  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  35.06 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  35.5 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  36.91 
 
 
231 aa  154  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  38.36 
 
 
251 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  40.34 
 
 
238 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  40.59 
 
 
225 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  41.09 
 
 
225 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  38.03 
 
 
225 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  34.17 
 
 
240 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  34.18 
 
 
237 aa  141  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  34.48 
 
 
233 aa  141  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  29.66 
 
 
243 aa  139  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  35.9 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  35.19 
 
 
226 aa  138  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  35.04 
 
 
230 aa  135  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  30.6 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  34.19 
 
 
233 aa  131  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  33.05 
 
 
236 aa  128  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  35.18 
 
 
236 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  31.19 
 
 
252 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  28.7 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  32.95 
 
 
239 aa  90.9  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  32.75 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  33.72 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  29.95 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  32.52 
 
 
250 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  32.93 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  35.04 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  31.16 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  31.33 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  29.38 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  29.83 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  29.31 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  30.41 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  30.39 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  29.28 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  32.26 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  32.8 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  32.93 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  26.7 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  29.89 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  29.89 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  28.66 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  28.72 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  29.88 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  29.65 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  29.26 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  28.75 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  28.75 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  30.34 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  29.24 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  27.49 
 
 
278 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  30.06 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  29.67 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  28.89 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  25.31 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  31.08 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  29.89 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  30.77 
 
 
241 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  33.09 
 
 
229 aa  62.8  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  29.12 
 
 
505 aa  62  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  29.59 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34923  predicted protein  29.28 
 
 
312 aa  60.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366717  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  30.95 
 
 
505 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  29.87 
 
 
389 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  29.05 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  29.05 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  26.9 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1912  GMP synthase, large subunit  27.5 
 
 
525 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0015  GMP synthase  25.89 
 
 
532 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.235317 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  26.19 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  30.67 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  25.13 
 
 
525 aa  59.3  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  24.37 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4147  GMP synthase  28.29 
 
 
525 aa  59.3  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.712191  normal  0.0751509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  31.36 
 
 
243 aa  58.9  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  26.13 
 
 
261 aa  58.9  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  29.05 
 
 
243 aa  58.9  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  31.01 
 
 
230 aa  58.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1489  GMP synthase, small subunit  31.72 
 
 
184 aa  58.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  28.22 
 
 
236 aa  58.5  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  29.45 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  31.72 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  28.64 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3123  GMP synthase  24.1 
 
 
525 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  29.75 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.696957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>