66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1959 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1959  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  987    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1953  hypothetical protein  77.75 
 
 		 480 aa  773    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.03 
 
 		 821 aa  89.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  29.69 
 
 		 553 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  30.77 
 
 		 569 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  28.77 
 
 		 560 aa  74.7  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  25.07 
 
 		 778 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.88 
 
 		 818 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.18 
 
 		 563 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.73 
 
 		 556 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  31.84 
 
 		 784 aa  67.8  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  25.14 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.71 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  29 
 
 		 546 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.85 
 
 		 1919 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.85 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  23.84 
 
 		 792 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.21 
 
 		 555 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  25.53 
 
 		 551 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.88 
 
 		 570 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  25.9 
 
 		 558 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.54 
 
 		 1679 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.24 
 
 		 1147 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  28.73 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.37 
 
 		 567 aa  58.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  26.67 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  25.99 
 
 		 743 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  26.52 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.52 
 
 		 837 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  25.67 
 
 		 579 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  29.45 
 
 		 363 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  31.52 
 
 		 376 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.33 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  29.45 
 
 		 363 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  26.85 
 
 		 593 aa  54.3  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  23.36 
 
 		 776 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  26.43 
 
 		 461 aa  53.9  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  32.8 
 
 		 577 aa  53.5  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  30.69 
 
 		 717 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  32.52 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  28.7 
 
 		 450 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  28.5 
 
 		 643 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_6750  predicted protein  33.94 
 
 		 212 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0046022  normal  0.726599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.71 
 
 		 555 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  33.33 
 
 		 737 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  29.35 
 
 		 911 aa  50.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  28.8 
 
 		 554 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  26.17 
 
 		 1129 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  27.4 
 
 		 469 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.75 
 
 		 706 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  27.01 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  29.21 
 
 		 714 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.31 
 
 		 787 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  25 
 
 		 328 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  28.65 
 
 		 566 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  25.7 
 
 		 1848 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  27.11 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.78 
 
 		 209 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  27.73 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  28.99 
 
 		 332 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  28.31 
 
 		 728 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.08 
 
 		 1126 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51473  predicted protein  29.38 
 
 		 1448 aa  43.9  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  29.94 
 
 		 341 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  28.99 
 
 		 1222 aa  43.5  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>