More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2625 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2710  arginine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 259 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.387661  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2625  arginine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 242 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1583  arginine transporter ATP-binding subunit  99.59 
 
 		 259 aa  495  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1656  arginine transporter ATP-binding subunit  92.15 
 
 		 242 aa  461  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.563363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00869  arginine transporter subunit  87.19 
 
 		 242 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.458857  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2778  ABC transporter related protein  87.19 
 
 		 242 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0132632  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2467  arginine transporter ATP-binding subunit  87.19 
 
 		 242 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1702  arginine transporter ATP-binding subunit  87.6 
 
 		 249 aa  443  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0357255  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0968  arginine transporter ATP-binding subunit  87.19 
 
 		 242 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0937  arginine transporter ATP-binding subunit  87.19 
 
 		 242 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1024  arginine transporter ATP-binding subunit  87.19 
 
 		 242 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2732  arginine transporter ATP-binding subunit  87.19 
 
 		 242 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.201208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0892  arginine transporter ATP-binding subunit  87.19 
 
 		 242 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.964935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0995  arginine transporter ATP-binding subunit  85.95 
 
 		 242 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.938307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0963  arginine transporter ATP-binding subunit  85.95 
 
 		 242 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1026  arginine transporter ATP-binding subunit  85.95 
 
 		 242 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1968  arginine transporter ATP-binding subunit  87.19 
 
 		 249 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1045  arginine transporter ATP-binding subunit  85.95 
 
 		 242 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0928  arginine transporter ATP-binding subunit  85.95 
 
 		 242 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2376  ABC transporter related  85.12 
 
 		 249 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1380  arginine transporter ATP-binding subunit  85.95 
 
 		 242 aa  434  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.374125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2276  ABC transporter related  83.47 
 
 		 249 aa  421  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0251  arginine transporter ATP-binding subunit  69.14 
 
 		 269 aa  348  3e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000905563  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0323  arginine transporter ATP-binding subunit  69.83 
 
 		 242 aa  337  9e-92  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001572  arginine ABC transporter ATP-binding protein ArtP  62.81 
 
 		 242 aa  317  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697194  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0701  arginine transporter ATP-binding subunit  63.22 
 
 		 247 aa  316  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05528  arginine transporter ATP-binding subunit  63.22 
 
 		 247 aa  315  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  48.18 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  46.44 
 
 		 244 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  47.13 
 
 		 299 aa  228  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.86 
 
 		 244 aa  228  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0590  arginine ABC transporter, ATP-binding protein  46.72 
 
 		 250 aa  228  8e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.501959  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1595  arginine transport ATP-binding protein  46.72 
 
 		 250 aa  228  8e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.552324  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.44 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.44 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.44 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.44 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 		 244 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.95 
 
 		 592 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  44.81 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  47.3 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  46.06 
 
 		 260 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  45.53 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1152  ABC transporter related  48.55 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  45.64 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  45.68 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  44.81 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.03 
 
 		 244 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.03 
 
 		 244 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  48.36 
 
 		 272 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  47.52 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  45.19 
 
 		 244 aa  221  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  43.98 
 
 		 241 aa  221  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 256 aa  221  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  46.69 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1120  ABC transporter related  44.76 
 
 		 249 aa  221  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  46.86 
 
 		 245 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  45.23 
 
 		 247 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  47.3 
 
 		 248 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.6 
 
 		 581 aa  220  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  43.7 
 
 		 252 aa  220  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  45.42 
 
 		 248 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  46.84 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4859  ABC transporter related  43.33 
 
 		 266 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.430729 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  46.28 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.75 
 
 		 267 aa  219  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  45.61 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  44.63 
 
 		 244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.47 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  45.87 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  46.12 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  48.32 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  43.33 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.44 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  45.34 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2883  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410522  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  46.06 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1260  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  47.23 
 
 		 252 aa  218  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.0306795 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.06 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  44.4 
 
 		 260 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.06 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.06 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  44.76 
 
 		 260 aa  218  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  43.55 
 
 		 260 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 254 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  43.33 
 
 		 248 aa  218  7.999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1133  ABC transporter related  45.45 
 
 		 243 aa  218  8.999999999999998e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.010872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.62 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1599  ABC transporter related  47.73 
 
 		 261 aa  217  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  46.06 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  46.25 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  46.06 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0121  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  44.26 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  45.23 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  45.23 
 
 		 247 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  45.64 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0535  ABC transporter related  45.93 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>