More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2517 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2517  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  100 
 
 
239 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2607  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
239 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2970  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  100 
 
 
239 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.532965  hitchhiker  0.0000356606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  28.9 
 
 
267 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2883  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  32.12 
 
 
258 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.678974  normal  0.736618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.97 
 
 
253 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2437  enoyl-CoA hydratase  31.89 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.5 
 
 
273 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.05 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.32 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.05 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2206  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 
259 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0233003  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5736  enoyl-CoA hydratase  29.23 
 
 
259 aa  85.1  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112015  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4874  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.9 
 
 
268 aa  85.1  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.83 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287025  decreased coverage  0.00358317 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.46 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3258  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686991  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.92 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3630  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.83 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.89 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.84 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0102  enoyl-CoA hydratase  29.19 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  30.82 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  29.26 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.82 
 
 
261 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  30.82 
 
 
261 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  26.32 
 
 
268 aa  82  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  26.32 
 
 
268 aa  82  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  30.82 
 
 
261 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  30.82 
 
 
261 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  30.82 
 
 
297 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  25.79 
 
 
264 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  30.82 
 
 
297 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3732  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.18 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.407726  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.03 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.27 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2941  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0701777  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.6 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3304  enoyl-CoA hydratase  31.18 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  25.51 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2522  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.27 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  27.23 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  25.97 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  25.13 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.13 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.87 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0041  enoyl-CoA hydratase  29.61 
 
 
263 aa  78.6  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  29.19 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2115  enoyl-CoA hydratase  26.7 
 
 
281 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.322248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2031  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.83 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  30.19 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  30.19 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2974  methylglutaconyl-CoA hydratase  30.46 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.240508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  21.49 
 
 
258 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  30.19 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.81 
 
 
260 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  29.71 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  30.19 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  27.17 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8048  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.61 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.540913  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.86 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  26.96 
 
 
261 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  26.18 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.46 
 
 
266 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4528  enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.46 
 
 
266 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0222933  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  30.19 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.46 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3943  enoyl-CoA hydratase  30.99 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  26.18 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.47 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  24.34 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2008  enoyl-CoA hydratase  26.11 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.34 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  26.22 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  25.13 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3199  enoyl-CoA hydratase  36.28 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0460733  normal  0.284798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.01 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02193  enoyl-CoA hydratase  26.52 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.114495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  27.67 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  27.32 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0889  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.38 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65979 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5245  enoyl-CoA hydratase  27.57 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  25.93 
 
 
318 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5442  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.18 
 
 
692 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  28.16 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.97 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  27.27 
 
 
260 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  23.4 
 
 
257 aa  75.1  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.27 
 
 
262 aa  75.1  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3459  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.75 
 
 
260 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.44 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.17 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.71 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.49 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.388199  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1173  enoyl-CoA hydratase  25 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  23.81 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  26.01 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.72 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.28043  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  24.31 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>