265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0614 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02262  predicted outer membrane export usher protein  41.34 
 
 		 881 aa  692    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0233  fimbrial usher protein  44.82 
 
 		 885 aa  740    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.516859  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4146  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  46.32 
 
 		 846 aa  811    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3089  fimbrial usher protein  44.32 
 
 		 881 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3270  fimbrial usher protein  44.44 
 
 		 881 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142463  normal  0.0139544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0825  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.71 
 
 		 845 aa  692    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3172  fimbrial usher protein  44.44 
 
 		 881 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.287175  normal  0.39987 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0252  fimbrial usher protein  97.09 
 
 		 826 aa  1659    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00772695  hitchhiker  0.00000864074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4673  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  48.61 
 
 		 828 aa  842    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0695  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  97.22 
 
 		 826 aa  1660    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2632  fimbrial usher family protein  41.71 
 
 		 881 aa  695    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3153  fimbrial usher protein  44.44 
 
 		 881 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.112503 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4723  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  47.42 
 
 		 844 aa  824    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0217  fimbrial usher protein  44.7 
 
 		 885 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.609825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2489  fimbrial usher family protein  41.39 
 
 		 880 aa  691    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0232  fimbrial usher protein  44.46 
 
 		 885 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.68 
 
 		 832 aa  674    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0403  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  46.53 
 
 		 835 aa  790    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2496  fimbrial usher protein  40.41 
 
 		 882 aa  667    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3480  fimbrial usher protein  41.27 
 
 		 860 aa  687    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0614  fimbrial usher protein  100 
 
 		 826 aa  1704    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2717  fimbrial usher family protein  41.64 
 
 		 880 aa  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.405081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1315  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.83 
 
 		 881 aa  694    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4106  fimbrial usher protein  42.74 
 
 		 830 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0215  fimbrial usher protein  44.58 
 
 		 885 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00519356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3247  fimbrial usher protein  39.5 
 
 		 829 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239063  normal  0.0404863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3261  fimbrial usher protein  39.38 
 
 		 829 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.313341 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3198  fimbrial usher protein  39.5 
 
 		 829 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3184  fimbrial usher protein  39.5 
 
 		 829 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3363  fimbrial usher protein  39.38 
 
 		 829 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0678454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0653  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.71 
 
 		 832 aa  560  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3222  fimbrial usher protein  36.55 
 
 		 833 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000448746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3509  fimbrial usher protein  36.75 
 
 		 834 aa  557  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00630946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02916  predicted outer membrane usher protein  36.87 
 
 		 822 aa  555  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.89 
 
 		 821 aa  554  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02866  hypothetical protein  37.04 
 
 		 812 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419634  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0808  fimbrial usher protein  36.7 
 
 		 816 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.404851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0744  fimbrial usher family protein  35.83 
 
 		 833 aa  524  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2937  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.83 
 
 		 819 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0766  fimbrial usher family protein  35.83 
 
 		 833 aa  523  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00678  predicted outer membrane protein  35.81 
 
 		 816 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.9 
 
 		 828 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1147  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.74 
 
 		 828 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0635  fimbrial usher family protein  35.59 
 
 		 833 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1627  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.74 
 
 		 828 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4772  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.73 
 
 		 828 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1524  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.53 
 
 		 828 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1611  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.3 
 
 		 829 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0173282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1547  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.65 
 
 		 817 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160729  normal  0.526328 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2918  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.59 
 
 		 818 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.528881  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00667  hypothetical protein  36.18 
 
 		 792 aa  502  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2061  MrfC  35.88 
 
 		 813 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.88 
 
 		 813 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1910  fimbrial usher protein  35.88 
 
 		 813 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1897  fimbrial usher protein  35.62 
 
 		 813 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02223  hypothetical protein  41.92 
 
 		 579 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04794  porin PapC  31.63 
 
 		 820 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.37 
 
 		 866 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  29.84 
 
 		 878 aa  298  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  29.84 
 
 		 863 aa  298  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  29.84 
 
 		 878 aa  298  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  29.72 
 
 		 878 aa  295  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.72 
 
 		 878 aa  295  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.44 
 
 		 877 aa  293  8e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.37 
 
 		 837 aa  290  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  29.43 
 
 		 856 aa  289  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.42 
 
 		 840 aa  285  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  28.95 
 
 		 850 aa  282  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  28.95 
 
 		 833 aa  282  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.75 
 
 		 867 aa  281  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.94 
 
 		 880 aa  280  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  28.83 
 
 		 833 aa  280  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.12 
 
 		 876 aa  280  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  28.78 
 
 		 833 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.11 
 
 		 851 aa  278  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  27.57 
 
 		 865 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.44 
 
 		 861 aa  277  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0150  putative outer membrane usher protein  28.4 
 
 		 866 aa  277  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0557898  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.3 
 
 		 838 aa  277  6e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  28.3 
 
 		 838 aa  277  7e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  28.3 
 
 		 838 aa  277  7e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.19 
 
 		 1040 aa  276  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.5 
 
 		 850 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.93 
 
 		 886 aa  274  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.61 
 
 		 851 aa  273  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  28.05 
 
 		 863 aa  272  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.14 
 
 		 859 aa  272  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  28.05 
 
 		 838 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  27.93 
 
 		 838 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.93 
 
 		 838 aa  270  7e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.7 
 
 		 865 aa  270  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  28.52 
 
 		 851 aa  270  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  28.31 
 
 		 866 aa  269  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  28.31 
 
 		 861 aa  269  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1499  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.42 
 
 		 832 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.43 
 
 		 930 aa  269  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0025  outer membrane usher protein FimD  29.18 
 
 		 888 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.028823  normal  0.118886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0024  outer membrane usher protein FimD  29.18 
 
 		 873 aa  269  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.267854  normal  0.163844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0026  outer membrane usher protein FimD  29.18 
 
 		 888 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  28.32 
 
 		 871 aa  268  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>