More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3881 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0966  ABC transporter related  99.4 
 
 		 502 aa  1020    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0912  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  99.4 
 
 		 502 aa  1020    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3881  sugar transport ATP-binding protein  100 
 
 		 502 aa  1026    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0578526 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2284  ABC transporter related  58.87 
 
 		 494 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0249  ABC transporter component  56.44 
 
 		 493 aa  533  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0268324  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4065  ABC transporter related  53.68 
 
 		 505 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0517348  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1632  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  54.27 
 
 		 486 aa  487  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1576  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  53.47 
 
 		 492 aa  488  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.369158  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1397  ABC transporter related  51.65 
 
 		 492 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0472986  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0455  ABC-type sugar transport system, ATPase component  48.98 
 
 		 493 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1814  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.78 
 
 		 493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.325907  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0812  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.78 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1103  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.78 
 
 		 493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0360  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.98 
 
 		 493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2076  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.78 
 
 		 493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2046  ABC transporter related  46.01 
 
 		 489 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.470002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4583  ABC transporter related  47.35 
 
 		 500 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2571  ABC transporter  46.96 
 
 		 495 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  45.1 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22100  ABC transporter protein  46.64 
 
 		 497 aa  428  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  42.68 
 
 		 513 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.14 
 
 		 524 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  42.68 
 
 		 513 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  44.69 
 
 		 494 aa  415  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  41.94 
 
 		 524 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  42.43 
 
 		 512 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.07 
 
 		 527 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  41.46 
 
 		 524 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  42.11 
 
 		 513 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  41.33 
 
 		 524 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  41.33 
 
 		 524 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  42.33 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  42.04 
 
 		 516 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  41.33 
 
 		 524 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  41.75 
 
 		 515 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  41.46 
 
 		 511 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  40.85 
 
 		 518 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  42.38 
 
 		 517 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  42.21 
 
 		 497 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  42.38 
 
 		 517 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  41.01 
 
 		 523 aa  398  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  43.43 
 
 		 503 aa  398  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  43.15 
 
 		 514 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  42.91 
 
 		 516 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.36 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.85 
 
 		 506 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  42.36 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  42.36 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  42.54 
 
 		 515 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  42.36 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  40.9 
 
 		 506 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  41.98 
 
 		 517 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  42 
 
 		 524 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  42.62 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  42.91 
 
 		 516 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  42.91 
 
 		 516 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  42.36 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  42.36 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  42.38 
 
 		 517 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  43.61 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  42.37 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  43.88 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  42.91 
 
 		 516 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  42.36 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  40.12 
 
 		 506 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  42.91 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  40.61 
 
 		 521 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  41.99 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  42.16 
 
 		 501 aa  391  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  42.8 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  42.04 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 496 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  41.99 
 
 		 517 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  42.16 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  42.51 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  41.43 
 
 		 525 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  42.45 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  42.16 
 
 		 517 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  42.74 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  41.13 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  43.06 
 
 		 500 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  41.45 
 
 		 499 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  41.31 
 
 		 520 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 525 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.51 
 
 		 496 aa  385  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.03 
 
 		 517 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  41.38 
 
 		 514 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  41.45 
 
 		 499 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  41.87 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  41.38 
 
 		 514 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  41.87 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.03 
 
 		 517 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.03 
 
 		 517 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  39.88 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  41.18 
 
 		 517 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.57 
 
 		 517 aa  382  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  41.18 
 
 		 514 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.46 
 
 		 512 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3018  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 		 506 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>