More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2818 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  99.41 
 
 
343 aa  695    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2818  beta-hexosaminidase  100 
 
 
340 aa  700    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.743458  normal  0.716469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  99.41 
 
 
343 aa  695    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  83.88 
 
 
339 aa  586  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2794  beta-hexosaminidase  79.76 
 
 
342 aa  568  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2488  beta-hexosaminidase  78.87 
 
 
342 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  76.95 
 
 
337 aa  538  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2540  glycoside hydrolase family 3 domain protein  76.12 
 
 
341 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100347  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01103  beta-hexosaminidase  75.82 
 
 
341 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01111  hypothetical protein  75.82 
 
 
341 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1229  beta-hexosaminidase  75.82 
 
 
341 aa  533  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000622374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2019  beta-hexosaminidase  75.52 
 
 
341 aa  529  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.760849  hitchhiker  0.0000464707 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1230  beta-hexosaminidase  75.52 
 
 
341 aa  530  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.644822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1487  beta-hexosaminidase  75.22 
 
 
341 aa  528  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018641 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2216  beta-hexosaminidase  75.22 
 
 
341 aa  528  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.350801  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2494  beta-hexosaminidase  75.52 
 
 
341 aa  530  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.566967  hitchhiker  0.00000031052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  74.63 
 
 
365 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1285  beta-hexosaminidase  74.63 
 
 
341 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1976  beta-hexosaminidase  74.63 
 
 
341 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1323  beta-hexosaminidase  74.63 
 
 
341 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1308  beta-hexosaminidase  74.63 
 
 
341 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000148932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2160  beta-hexosaminidase  74.63 
 
 
341 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.925801  hitchhiker  0.000000512637 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  72.11 
 
 
348 aa  510  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0223  beta-hexosaminidase  56.19 
 
 
330 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0575  beta-hexosaminidase  54.68 
 
 
331 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1132  beta-hexosaminidase  53.2 
 
 
351 aa  377  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00323913  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  53.05 
 
 
327 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00991  beta-hexosaminidase  53.82 
 
 
327 aa  354  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  49.7 
 
 
337 aa  347  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1716  beta-hexosaminidase  51.35 
 
 
332 aa  333  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1807  beta-hexosaminidase  51.06 
 
 
337 aa  322  8e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2170  beta-hexosaminidase  55.48 
 
 
342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1726  beta-hexosaminidase  51.38 
 
 
342 aa  318  9e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2293  beta-hexosaminidase  51.07 
 
 
342 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.610564  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1805  beta-hexosaminidase  51.98 
 
 
342 aa  315  6e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1539  beta-hexosaminidase  51.08 
 
 
355 aa  315  7e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2250  beta-hexosaminidase  50.6 
 
 
342 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  52.11 
 
 
336 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1626  beta-hexosaminidase  52.76 
 
 
333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000974733  normal  0.195617 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  47.92 
 
 
344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  55.3 
 
 
356 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  48.35 
 
 
337 aa  309  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  49.23 
 
 
341 aa  309  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1326  beta-hexosaminidase  54.86 
 
 
341 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  52.58 
 
 
332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  49.4 
 
 
347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  48.21 
 
 
341 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  49.85 
 
 
336 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2837  beta-hexosaminidase  46.63 
 
 
333 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0312091  hitchhiker  0.000147131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  50.76 
 
 
336 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  55 
 
 
336 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2067  glycoside hydrolase family protein  48.95 
 
 
340 aa  297  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.268597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  50.46 
 
 
336 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.72 
 
 
348 aa  296  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1943  beta-hexosaminidase  50.76 
 
 
342 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.531769  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2416  beta-hexosaminidase  50.76 
 
 
342 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2523  beta-hexosaminidase  50.76 
 
 
342 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.352424  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2405  beta-hexosaminidase  50.46 
 
 
342 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.842865  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  50.48 
 
 
349 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  49.85 
 
 
336 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02440  beta-hexosaminidase  50.69 
 
 
340 aa  292  6e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  49.85 
 
 
336 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  49.85 
 
 
336 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  49.39 
 
 
359 aa  291  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1984  beta-hexosaminidase  47.69 
 
 
334 aa  289  6e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.132331  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  45.03 
 
 
356 aa  285  7e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  50 
 
 
349 aa  280  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.65 
 
 
346 aa  275  6e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  54.48 
 
 
327 aa  275  8e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2307  beta-hexosaminidase  47.57 
 
 
381 aa  272  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  48.4 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  48.04 
 
 
360 aa  268  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  43.73 
 
 
357 aa  265  7e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  50 
 
 
347 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0655  glycosy hydrolase family protein  49.49 
 
 
347 aa  263  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448002  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2413  beta-hexosaminidase  47.44 
 
 
349 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.096401 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  42.95 
 
 
313 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  42.63 
 
 
313 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2247  beta-hexosaminidase  47.44 
 
 
349 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0933  beta-hexosaminidase  44.06 
 
 
349 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0408142  normal  0.050021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  44.44 
 
 
342 aa  252  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1019  beta-hexosaminidase  44.94 
 
 
342 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0998  beta-hexosaminidase  43.75 
 
 
349 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2835  beta-hexosaminidase  46.2 
 
 
342 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0548  beta-hexosaminidase  46.2 
 
 
342 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2774  beta-hexosaminidase  46.2 
 
 
342 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2889  beta-hexosaminidase  46.2 
 
 
342 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2820  beta-hexosaminidase  46.2 
 
 
342 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.24602  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1784  beta-hexosaminidase  46.2 
 
 
342 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2461  beta-hexosaminidase  46.2 
 
 
342 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1015  beta-hexosaminidase  48.3 
 
 
342 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.791894  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.13 
 
 
362 aa  249  4e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  44.14 
 
 
342 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4251  beta-hexosaminidase  47.04 
 
 
342 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2165  beta-hexosaminidase  47.62 
 
 
342 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.424583 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1068  beta-hexosaminidase  44.85 
 
 
350 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0051556  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  46.24 
 
 
335 aa  246  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0659  beta-hexosaminidase  44.64 
 
 
342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1139  beta-hexosaminidase  44.64 
 
 
342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1097  beta-hexosaminidase  44.64 
 
 
342 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>