More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2256 on replicon NC_010579
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010579  XfasM23_2256  parB-like partition protein  100 
 
 		 343 aa  694    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6444  ParB family protein  69.35 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6603  parB-like partition proteins  69.35 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4306  ParB family protein  68.3 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  54.89 
 
 		 350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0783  parB-like partition protein  30.79 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000781994 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6342  parB-like partition protein  38.39 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.291043 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4936  parB-like partition protein  34.43 
 
 		 298 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153012  normal  0.946011 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5811  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 299 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0015  putative ParB-like (korB) partition protein  26.95 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.122809 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0050  putative ParB partition protein  34.51 
 
 		 393 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  31.03 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4975  parB-like partition protein  26.99 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  30 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  34.78 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  33.12 
 
 		 294 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  33.7 
 
 		 285 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  34.03 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  32.05 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  35.12 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  33.89 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  32.28 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  36.11 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  37.84 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  33.33 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  37.84 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  37.84 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  37.84 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  37.84 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  32.98 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  37.84 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  37.84 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4468  parB-like partition proteins  26.02 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.99602  hitchhiker  7.6726e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  37.84 
 
 		 256 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  32.52 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0893  parB-like partition protein  36.84 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  33.74 
 
 		 289 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  36.99 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  36.99 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  31.91 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  35.98 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  32.42 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  32.64 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  31.79 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  33.89 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4698  parB-like partition proteins  31.25 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  32.54 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  30.73 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  36.31 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  30.23 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  32.12 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  31.72 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  30.41 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  36 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  30.41 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  32.7 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  31.72 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  26.21 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  36 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  32.1 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  30.05 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  29.94 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0940  parB-like partition protein  32.29 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  29.03 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  30.2 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  33.11 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  34.69 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  32.67 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  34.46 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  30.56 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  29.41 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  32.67 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  39.42 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  29.63 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  28.22 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  33.92 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  31.76 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  28.71 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  30.3 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  31.06 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  34.13 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  30.37 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  30.73 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  32.69 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0105  effector of nucleoid occlusion Noc  32.32 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000144978  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  33.99 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  33.99 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1542  parB-like partition protein  29.27 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160995  unclonable  1.80022e-19 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  31.82 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  31.45 
 
 		 292 aa  67  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  31.36 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  31.25 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  31.25 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  31.85 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  32.48 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  29.13 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  31.61 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  35.1 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>