More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2443 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
309 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17893  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19720  short-chain alcohol dehydrogenase  60.52 
 
 
312 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608128  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  35.58 
 
 
306 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  35.58 
 
 
306 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
312 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
301 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  32.48 
 
 
305 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.67 
 
 
298 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 
306 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
312 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  35.33 
 
 
304 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  33.66 
 
 
317 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 
312 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
312 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 
308 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  32.25 
 
 
300 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  32.25 
 
 
300 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  32.25 
 
 
300 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  35.33 
 
 
300 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.39 
 
 
328 aa  99.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 
324 aa  99.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  33.45 
 
 
306 aa  99.4  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2577  short chain dehydrogenase  34.97 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.17 
 
 
329 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  31.17 
 
 
329 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  31.17 
 
 
333 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 
303 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.82 
 
 
317 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 
314 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  32.04 
 
 
305 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  31.39 
 
 
311 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 
314 aa  92.8  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 
303 aa  92.8  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
316 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.21 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.44 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 
326 aa  89.7  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 
320 aa  89  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.79 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
320 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  26.5 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  32.58 
 
 
303 aa  87  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  26.15 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.85 
 
 
303 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
328 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
328 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
328 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  34.08 
 
 
299 aa  85.9  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  27.63 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  25.8 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  31.53 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  25.65 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  24.36 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.51 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.62 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  26.55 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4041  short chain dehydrogenase  38.28 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138801  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.83 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
328 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.36 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  27.42 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66520  putative short chain dehydrogenase  29.45 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.973643  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4187  short chain dehydrogenase  35.62 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5768  putative short chain dehydrogenase  33.81 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0618  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  27.94 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2697  putative daunorubicin C-13 ketoreductase  32.42 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114176  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 
297 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.91 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  29.86 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.2 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>