86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2433 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2433  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
195 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5148  pgam5; phosphoglycerate mutase family member 5  60.2 
 
 
204 aa  226  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.477375  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4549  phosphoglycerate mutase  61.03 
 
 
200 aa  226  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0075  Phosphoglycerate mutase  61.26 
 
 
199 aa  213  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193041  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0458  Phosphoglycerate mutase  58.25 
 
 
198 aa  204  9e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.977628  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2012  Phosphoglycerate mutase  40.64 
 
 
190 aa  104  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1836  Phosphoglycerate mutase  32.82 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2929  phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  25.35 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17454  predicted protein  29.19 
 
 
291 aa  58.9  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.408947  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.14 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
213 aa  54.7  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  30.33 
 
 
213 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  25.24 
 
 
209 aa  53.9  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  25.37 
 
 
213 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 
213 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 
411 aa  52.4  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  25.38 
 
 
196 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.55 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  24.57 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3338  phosphoglycerate mutase  25.5 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000263066  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  26.51 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  29.45 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  25.38 
 
 
196 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  25.38 
 
 
196 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  25.89 
 
 
196 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  25.38 
 
 
196 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2160  phosphoglycerate mutase family protein  25.38 
 
 
196 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  24.37 
 
 
196 aa  48.5  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04610  hypothetical protein  35.44 
 
 
251 aa  48.5  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  25.38 
 
 
196 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 
221 aa  48.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  24.57 
 
 
216 aa  48.1  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  26.6 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  44 
 
 
205 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  21.46 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  24.12 
 
 
215 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  42.65 
 
 
235 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  24.87 
 
 
196 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  20.22 
 
 
196 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.04 
 
 
442 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  26.24 
 
 
214 aa  45.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.09 
 
 
442 aa  45.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.54 
 
 
150 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 
448 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 
412 aa  45.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
452 aa  45.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 
234 aa  45.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  50 
 
 
197 aa  45.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 
448 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 
207 aa  45.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  38.96 
 
 
157 aa  45.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  40.96 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  23.35 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36 
 
 
442 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  39.8 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  29.68 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  39.02 
 
 
241 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  39.39 
 
 
443 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  25.28 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  38.78 
 
 
154 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  55.81 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  22.58 
 
 
442 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37572  predicted protein  41.38 
 
 
977 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.421794  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37201  predicted protein  32.61 
 
 
311 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  45.83 
 
 
273 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  46 
 
 
240 aa  42.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  41.1 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
208 aa  42.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  43.86 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  43.59 
 
 
189 aa  42  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 
194 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  24.1 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  22.16 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 
447 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  62.16 
 
 
245 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  38.03 
 
 
442 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 
378 aa  41.6  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  42.25 
 
 
223 aa  41.2  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  41.38 
 
 
235 aa  41.2  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>